HACL1

HACL1
Ідентифікатори
Символи	HACL1, 2-HPCL, HPCL, HPCL2, PHYH2, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604300 MGI: 1929657 HomoloGene: 5794 GeneCards: HACL1
Онтологія гена Молекулярна функція • thiamine pyrophosphate binding • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • lyase activity • carbon-carbon lyase activity • identical protein binding Клітинна компонента • пероксисома • peroxisomal matrix • гіалоплазма Біологічний процес • fatty acid alpha-oxidation • protein complex oligomerization • fatty acid metabolic process • protein targeting to peroxisome • lipid metabolism Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26061	56794
Ensembl	ENSG00000131373	ENSMUSG00000021884
UniProt	Q9UJ83	Q9QXE0
RefSeq (мРНК)	NM_001284413 NM_001284415 NM_001284416 NM_012260	NM_019975
RefSeq (білок)	NP_001271342 NP_001271344 NP_001271345 NP_036392	NP_064359
Локус (UCSC)	Хр. 3: 15.56 – 15.6 Mb	Хр. 14: 31.32 – 31.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HACL1 (англ. 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 578 амінокислот, а молекулярна маса — 63 729.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPDSNFAERS		EEQVSGAKVI		AQALKTQDVE		YIFGIVGIPV		TEIAIAAQQL
GIKYIGMRNE		QAACYAASAI		GYLTSRPGVC		LVVSGPGLIH		ALGGMANANM
NCWPLLVIGG		SSERNQETMG		AFQEFPQVEA		CRLYTKFSAR		PSSIEAIPFV
IEKAVRSSIY		GRPGACYVDI		PADFVNLQVN		VNSIKYMERC		MSPPISMAET
SAVCTAASVI		RNAKQPLLII		GKGAAYAHAE		ESIKKLVEQY		KLPFLPTPMG
KGVVPDNHPY		CVGAARSRAL		QFADVIVLFG		ARLNWILHFG		LPPRYQPDVK
FIQVDICAEE		LGNNVKPAVT		LLGNIHAVTK		QLLEELDKTP		WQYPPESKWW
KTLREKMKSN		EAASKELASK		KSLPMNYYTV		FYHVQEQLPR		DCFVVSEGAN
TMDIGRTVLQ		NYLPRHRLDA		GTFGTMGVGL		GFAIAAAVVA		KDRSPGQWII
CVEGDSAFGF		SGMEVETICR		YNLPIILLVV		NNNGIYQGFD		TDTWKEMLKF
QDATAVVPPM		CLLPNSHYEQ		VMTAFGGKGY		FVQTPEELQK		SLRQSLADTT
KPSLINIMIE		PQATRKAQDF		HWLTRSNM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, тіамін-пірофосфатом. Локалізований у пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3