HCFC2

HCFC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WFT
Ідентифікатори
Символи	HCFC2, HCF-2, HCF2, host cell factor C2
Зовнішні ІД	OMIM: 607926 MGI: 1915183 HomoloGene: 8337 GeneCards: HCFC2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинна мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • MLL1 complex Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29915	67933
Ensembl	ENSG00000111727	ENSMUSG00000020246
UniProt	Q9Y5Z7	Q9D968
RefSeq (мРНК)	NM_013320	NM_001081218 NM_026462 NM_001368720
RefSeq (білок)	NP_037452	NP_001074687 NP_001355649
Локус (UCSC)	Хр. 12: 104.06 – 104.11 Mb	Хр. 10: 82.53 – 82.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HCFC2 (англ. Host cell factor C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 792 амінокислот, а молекулярна маса — 86 779.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPSLLNWR		RVSSFTGPVP		RARHGHRAVA		IRELMIIFGG		GNEGIADELH
VYNTATNQWF		LPAVRGDIPP		GCAAHGFVCD		GTRILVFGGM		VEYGRYSNEL
YELQASRWLW		KKVKPHPPPS		GLPPCPRLGH		SFSLYGNKCY		LFGGLANESE
DSNNNVPRYL		NDFYELELQH		GSGVVGWSIP		VTKGVVPSPR		ESHTAVIYCK
KDSGSPKMYV		FGGMCGARLD		DLWQLDLETM		SWSKPETKGT		VPLPRSLHTA
SVIGNKMYIF		GGWVPHKGEN		TETSPHDCEW		RCTSSFSYLN		LDTTEWTTLV
SDSQEDKKNS		RPRPRAGHCA		VAIGTRLYFW		SGRDGYKKAL		NSQVCCKDLW
YLDTEKPPAP		SQVQLIKATT		NSFHVKWDEV		STVEGYLLQL		STDLPYQAAS
SDSSAAPNMQ		GVRMDPHRQG		SNNIVPNSIN		DTINSTKTEQ		PATKETSMKN
KPDFKALTDS		NAILYPSLAS		NASNHNSHVV		DMLRKNEGPH		TSANVGVLSS
CLDVRTVIPE		TSVSSTVSST		QTMVTQQTIK		TESSSTNGAV		VKDETSLTTF
STKSEVDETY		ALPATKISRV		ETHATATPFS		KETPSNPVAT		VKAGERQWCD
VGIFKNNTAL		VSQFYLLPKG		KQSISKVGNA		DVPDYSLLKK		QDLVPGTGYR
FRVAAINGCG		IGPFSKISEF		KTCIPGFPGA		PSAVRISKNV		EGIHLSWEPP
TSPSGNILEY		SAYLAIRTAQ		IQDNPSQLVF		MRIYCGLKTS		CIVTAGQLAN
AHIDYTSRPA		IVFRISAKNE		KGYGPATQVR		WLQGNNKKAP		LN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Johnson K.M., Mahajan S.S., Wilson A.C. (1999). Herpes simplex virus transactivator VP16 discriminates between HCF-1 and a novel family member, HCF-2. J. Virol. 73: 3930—3940. PMID 10196288

Див. також

• Хромосома 12