HDGFL2

HDGFL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EAE, 3QBY, 3QJ6
Ідентифікатори
Символи	HDGFL2, HDGF-2, HDGF2, HRP-2, HDGFRP2, hepatoma-derived growth factor-related protein 2, HDGF like 2, HRP2
Зовнішні ІД	OMIM: 617884 MGI: 1194492 HomoloGene: 7355 GeneCards: HDGFL2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of cell growth Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84717	15193
Ensembl	ENSG00000167674	ENSMUSG00000002833
UniProt	Q7Z4V5	Q3UMU9
RefSeq (мРНК)	NM_001001520 NM_032631 NM_001348169	NM_008233 NM_001304784 NM_001304785 NM_001331053
RefSeq (білок)	NP_001001520 NP_116020 NP_001335098	NP_001291713 NP_001291714 NP_001317982 NP_032259
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.47 – 4.5 Mb	Хр. 17: 56.39 – 56.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HDGFL2 (англ. HDGF like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 671 амінокислот, а молекулярна маса — 74 317.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHAFKPGDL		VFAKMKGYPH		WPARIDDIAD		GAVKPPPNKY		PIFFFGTHET
AFLGPKDLFP		YDKCKDKYGK		PNKRKGFNEG		LWEIQNNPHA		SYSAPPPVSS
SDSEAPEANP		ADGSDADEDD		EDRGVMAVTA		VTATAASDRM		ESDSDSDKSS
DNSGLKRKTP		ALKMSVSKRA		RKASSDLDQA		SVSPSEEENS		ESSSESEKTS
DQDFTPEKKA		AVRAPRRGPL		GGRKKKKAPS		ASDSDSKADS		DGAKPEPVAM
ARSASSSSSS		SSSSDSDVSV		KKPPRGRKPA		EKPLPKPRGR		KPKPERPPSS
SSSDSDSDEV		DRISEWKRRD		EARRRELEAR		RRREQEEELR		RLREQEKEEK
ERRRERADRG		EAERGSGGSS		GDELREDDEP		VKKRGRKGRG		RGPPSSSDSE
PEAELEREAK		KSAKKPQSSS		TEPARKPGQK		EKRVRPEEKQ		QAKPVKVERT
RKRSEGFSMD		RKVEKKKEPS		VEEKLQKLHS		EIKFALKVDS		PDVKRCLNAL
EELGTLQVTS		QILQKNTDVV		ATLKKIRRYK		ANKDVMEKAA		EVYTRLKSRV
LGPKIEAVQK		VNKAGMEKEK		AEEKLAGEEL		AGEEAPQEKA		EDKPSTDLSA
PVNGEATSQK		GESAEDKEHE		EGRDSEEGPR		CGSSEDLHDS		VREGPDLDRP
GSDRQERERA		RGDSEALDEE		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19