HELQ

HELQ
Ідентифікатори
Символи	HELQ, HEL308, helicase, POLQ-like, helicase, POLQ like
Зовнішні ІД	OMIM: 606769 MGI: 2176740 HomoloGene: 14667 GeneCards: HELQ
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • double-strand break repair via homologous recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	113510	191578
Ensembl	ENSG00000163312	ENSMUSG00000035266
UniProt	Q8TDG4	Q2VPA6
RefSeq (мРНК)	NM_001297755 NM_001297756 NM_001297757 NM_001297758 NM_001297759 NM_133636	NM_001081107 NM_180984
RefSeq (білок)	NP_001284684 NP_001284685 NP_001284686 NP_001284687 NP_001284688 NP_598375	NP_001074576
Локус (UCSC)	Хр. 4: 83.41 – 83.46 Mb	Хр. 5: 100.91 – 100.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HELQ (англ. Helicase, POLQ like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 101 амінокислот, а молекулярна маса — 124 131.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDECGSRIRR		RVSLPKRNRP		SLGCIFGAPT		AAELVPGDEG		KEEEEMVAEN
RRRKTAGVLP		VEVQPLLLSD		SPECLVLGGG		DTNPDLLRHM		PTDRGVGDQP
NDSEVDMFGD		YDSFTENSFI		AQVDDLEQKY		MQLPEHKKHA		TDFATENLCS
ESIKNKLSIT		TIGNLTELQT		DKHTENQSGY		EGVTIEPGAD		LLYDVPSSQA
IYFENLQNSS		NDLGDHSMKE		RDWKSSSHNT		VNEELPHNCI		EQPQQNDESS
SKVRTSSDMN		RRKSIKDHLK		NAMTGNAKAQ		TPIFSRSKQL		KDTLLSEEIN
VAKKTVESSS		NDLGPFYSLP		SKVRDLYAQF		KGIEKLYEWQ		HTCLTLNSVQ
ERKNLIYSLP		TSGGKTLVAE		ILMLQELLCC		RKDVLMILPY		VAIVQEKISG
LSSFGIELGF		FVEEYAGSKG		RFPPTKRREK		KSLYIATIEK		GHSLVNSLIE
TGRIDSLGLV		VVDELHMIGE		GSRGATLEMT		LAKILYTSKT		TQIIGMSATL
NNVEDLQKFL		QAEYYTSQFR		PVELKEYLKI		NDTIYEVDSK		AENGMTFSRL
LNYKYSDTLK		KMDPDHLVAL		VTEVIPNYSC		LVFCPSKKNC		ENVAEMICKF
LSKEYLKHKE		KEKCEVIKNL		KNIGNGNLCP		VLKRTIPFGV		AYHHSGLTSD
ERKLLEEAYS		TGVLCLFTCT		STLAAGVNLP		ARRVILRAPY		VAKEFLKRNQ
YKQMIGRAGR		AGIDTIGESI		LILQEKDKQQ		VLELITKPLE		NCYSHLVQEF
TKGIQTLFLS		LIGLKIATNL		DDIYHFMNGT		FFGVQQKVLL		KEKSLWEITV
ESLRYLTEKG		LLQKDTIYKS		EEEVQYNFHI		TKLGRASFKG		TIDLAYCDIL
YRDLKKGLEG		LVLESLLHLI		YLTTPYDLVS		QCNPDWMIYF		RQFSQLSPAE
QNVAAILGVS		ESFIGKKASG		QAIGKKVDKN		VVNRLYLSFV		LYTLLKETNI
WTVSEKFNMP		RGYIQNLLTG		TASFSSCVLH		FCEELEEFWV		YRALLVELTK
KLTYCVKAEL		IPLMEVTGVL		EGRAKQLYSA		GYKSLMHLAN		ANPEVLVRTI
DHLSRRQAKQ		IVSSAKMLLH		EKAEALQEEV		EELLRLPSDF		PGAVASSTDK
A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК.

Література

• Marini F., Wood R.D. (2002). A human DNA helicase homologous to the DNA cross-link sensitivity protein Mus308. J. Biol. Chem. 277: 8716—8723. PMID 11751861 DOI:10.1074/jbc.M110271200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4