HERC3

HERC3
Ідентифікатори
Символи	HERC3, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605200 MGI: 1921248 HomoloGene: 57095 GeneCards: HERC3
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8916	73998
Ensembl	ENSG00000138641	ENSMUSG00000029804
UniProt	Q15034	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001271602 NM_014606 NM_001318505 NM_001375477 NM_001375478 NM_001375479 NM_001375480 NM_001375481 NM_001375482 NM_001375483	NM_028705 NM_001361966 NM_001361967
RefSeq (білок)	NP_001258531 NP_001305434 NP_055421 NP_001362406 NP_001362407 NP_001362408 NP_001362409 NP_001362410 NP_001362411 NP_001362412	н/д
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 6: 58.81 – 58.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HERC3 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 117 188.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLCWGYWSLG		QPGISTNLQG		IVAEPQVCGF		ISDRSVKEVA		CGGNHSVFLL
EDGEVYTCGL		NTKGQLGHER		EGNKPEQIGA		LADQHIIHVA		CGESHSLALS
DRGQLFSWGA		GSDGQLGLMT		TEDSVAVPRL		IQKLNQQTIL		QVSCGNWHCL
ALAADGQFFT		WGKNSHGQLG		LGKEFPSQAS		PQRVRSLEGI		PLAQVAAGGA
HSFALSLSGA		VFGWGMNNAG		QLGLSDEKDR		ESPCHVKLLR		TQKVVYISCG
EEHTAVLTKS		GGVFTFGAGS		CGQLGHDSMN		DEVNPRRVLE		LMGSEVTQIA
CGRQHTLAFV		PSSGLIYAFG		CGARGQLGTG		HTCNVKCPSP		VKGYWAAHSG
QLSARADRFK		YHIVKQIFSG		GDQTFVLCSK		YENYSPAVDF		RTMNQAHYTS
LINDETIAVW		RQKLSEHNNA		NTINGVVQIL		SSAACWNGSF		LEKKIDEHFK
TSPKIPGIDL		NSTRVLFEKL		MNSQHSMILE		QILNSFESCL		IPQLSSSPPD
VEAMRIYLIL		PEFPLLQDSK		YYITLTIPLA		MAILRLDTNP		SKVLDNWWSQ
VCPKYFMKLV		NLYKGAVLYL		LRGRKTFLIP		VLFNNYITAA		LKLLEKLYKV
NLKVKHVEYD		TFYIPEISNL		VDIQEDYLMW		FLHQAGMKAR		PSIIQDTVTL
CSYPFIFDAQ		AKTKMLQTDA		ELQMQVAVNG		ANLQNVFMLL		TLEPLLARSP
FLVLHVRRNN		LVGDALRELS		IHSDIDLKKP		LKVIFDGEEA		VDAGGVTKEF
FLLLLKELLN		PIYGMFTYYQ		DSNLLWFSDT		CFVEHNWFHL		IGITCGLAIY
NSTVVDLHFP		LALYKKLLNV		KPGLEDLKEL		SPTEGRSLQE		LLDYPGEDVE
ETFCLNFTIC		RESYGVIEQK		KLIPGGDNVT		VCKDNRQEFV		DAYVNYVFQI
SVHEWYTAFS		SGFLKVCGGK		VLELFQPSEL		RAMMVGNSNY		NWEELEETAI
YKGDYSATHP		TVKLFWETFH		EFPLEKKKKF		LLFLTGSDRI		PIYGMASLQI
VIQSTASGEE		YLPVAHTCYN		LLDLPKYSSK		EILSARLTQA		LDNYEGFSLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cruz C., Ventura F., Bartrons R., Rosa J.L. (2001). HERC3 binding to and regulation by ubiquitin. FEBS Lett. 488: 74—80. PMID 11163799 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02371-1

Див. також

• Хромосома 4