HMG20A

HMG20A
Ідентифікатори
Символи	HMG20A, HMGX1, HMGXB1, high mobility group 20A
Зовнішні ІД	OMIM: 605534 MGI: 1914117 HomoloGene: 32399 GeneCards: HMG20A
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of protein sumoylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10363	66867
Ensembl	ENSG00000140382	ENSMUSG00000032329
UniProt	Q9NP66	Q9DC33
RefSeq (мРНК)	NM_001304504 NM_001304505 NM_018200	NM_025812
RefSeq (білок)	NP_001291433 NP_001291434 NP_060670	NP_080088
Локус (UCSC)	Хр. 15: 77.42 – 77.49 Mb	Хр. 9: 56.33 – 56.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HMG20A (англ. High mobility group 20A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 40 144.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENLMTSSTL		PPLFADEDGS		KESNDLATTG		LNHPEVPYSS		GATSSTNNPE
FVEDLSQGQL		LQSESSNAAE		GNEQRHEDEQ		RSKRGGWSKG		RKRKKPLRDS
NAPKSPLTGY		VRFMNERREQ		LRAKRPEVPF		PEITRMLGNE		WSKLPPEEKQ
RYLDEADRDK		ERYMKELEQY		QKTEAYKVFS		RKTQDRQKGK		SHRQDAARQA
THDHEKETEV		KERSVFDIPI		FTEEFLNHSK		AREAELRQLR		KSNMEFEERN
AALQKHVESM		RTAVEKLEVD		VIQERSRNTV		LQQHLETLRQ		VLTSSFASMP
LPGSGETPTV		DTIDSYMNRL		HSIILANPQD		NENFIATVRE		VVNRLDR

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15