HNRNPA3

HNRNPA3
Ідентифікатори
Символи	HNRNPA3, 2610510D13Rik, D10S102, FBRNP, HNRPA3, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3
Зовнішні ІД	OMIM: 605372 MGI: 1917171 GeneCards: HNRNPA3
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA transmembrane transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • messenger ribonucleoprotein complex • neuron projection • ribonucleoprotein granule • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA transport • Сплайсинг РНК • RNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	220988	229279
Ensembl	ENSG00000170144	ENSMUSG00000059005
UniProt	P51991	Q8BG05
RefSeq (мРНК)	NM_001330247 NM_001330248 NM_001330249 NM_001330250 NM_001330251 NM_194247 NM_001395170	NM_053263 NM_146130 NM_198090 NM_001359971
RefSeq (білок)	NP_001317176 NP_001317177 NP_001317178 NP_001317179 NP_001317180 NP_919223	NP_444493 NP_666242 NP_932758 NP_001346900
Локус (UCSC)	Хр. 2: 177.21 – 177.22 Mb	Хр. 2: 75.49 – 75.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPA3 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 378 амінокислот, а молекулярна маса — 39 595.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVKPPPGRP		QPDSGRRRRR		RGEEGHDPKE		PEQLRKLFIG		GLSFETTDDS
LREHFEKWGT		LTDCVVMRDP		QTKRSRGFGF		VTYSCVEEVD		AAMCARPHKV
DGRVVEPKRA		VSREDSVKPG		AHLTVKKIFV		GGIKEDTEEY		NLRDYFEKYG
KIETIEVMED		RQSGKKRGFA		FVTFDDHDTV		DKIVVQKYHT		INGHNCEVKK
ALSKQEMQSA		GSQRGRGGGS		GNFMGRGGNF		GGGGGNFGRG		GNFGGRGGYG
GGGGGSRGSY		GGGDGGYNGF		GGDGGNYGGG		PGYSSRGGYG		GGGPGYGNQG
GGYGGGGGYD		GYNEGGNFGG		GNYGGGGNYN		DFGNYSGQQQ		SNYGPMKGGS
FGGRSSGSPY		GGGYGSGGGS		GGYGSRRF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Див. також

• Хромосома 2