IDH1

IDH1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1T09, 1T0L, 3INM, 3MAP, 3MAR, 3MAS, 4I3K, 4I3L, 4KZO, 4L03, 4L04, 4L06, 4UMX, 4UMY, 4XRX, 5DE1, 4XS3, 5K10, 5K11
Ідентифікатори
Символи	IDH1, HEL-216, HEL-S-26, IDCD, IDH, IDP, IDPC, PICD, isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1, cytosolic, isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147700 MGI: 96413 HomoloGene: 21195 GeneCards: IDH1
Пов'язані генетичні захворювання
гострий мієлоїдний лейкоз, гліобластома
Онтологія гена Молекулярна функція • magnesium ion binding • protein homodimerization activity • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • signaling receptor binding • isocitrate dehydrogenase (NADP+) activity • oxidoreductase activity • NAD binding • isocitrate dehydrogenase activity • NADP binding • зв'язування з іоном металу • (R)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase activity • cadherin binding • identical protein binding Клітинна компонента • пероксисома • гіалоплазма • екзосома • peroxisomal matrix • цитоплазма • мітохондрія • extracellular region • secretory granule lumen • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • female gonad development • NADPH regeneration • GO:0001306 response to oxidative stress • GO:1904578 response to organic cyclic compound • response to steroid hormone • 2-oxoglutarate metabolic process • regulation of phospholipid catabolic process • isocitrate metabolic process • glyoxylate cycle • цикл трикарбонових кислот • regulation of phospholipid biosynthetic process • glutathione metabolic process • neutrophil degranulation • protein targeting to peroxisome • NADP metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3417	15926
Ensembl	ENSG00000138413	ENSMUSG00000025950
UniProt	O75874	O88844
RefSeq (мРНК)	NM_005896 NM_001282386 NM_001282387	NM_001111320 NM_010497
RefSeq (білок)	NP_001269315 NP_001269316 NP_005887	NP_001104790 NP_034627
Локус (UCSC)	Хр. 2: 208.24 – 208.27 Mb	Хр. 1: 65.2 – 65.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IDH1 (англ. Isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1, cytosolic) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 46 659.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKKISGGSV		VEMQGDEMTR		IIWELIKEKL		IFPYVELDLH		SYDLGIENRD
ATNDQVTKDA		AEAIKKHNVG		VKCATITPDE		KRVEEFKLKQ		MWKSPNGTIR
NILGGTVFRE		AIICKNIPRL		VSGWVKPIII		GRHAYGDQYR		ATDFVVPGPG
KVEITYTPSD		GTQKVTYLVH		NFEEGGGVAM		GMYNQDKSIE		DFAHSSFQMA
LSKGWPLYLS		TKNTILKKYD		GRFKDIFQEI		YDKQYKSQFE		AQKIWYEHRL
IDDMVAQAMK		SEGGFIWACK		NYDGDVQSDS		VAQGYGSLGM		MTSVLVCPDG
KTVEAEAAHG		TVTRHYRMYQ		KGQETSTNPI		ASIFAWTRGL		AHRAKLDNNK
ELAFFANALE		EVSIETIEAG		FMTKDLAACI		KGLPNVQRSD		YLNTFEFMDK
LGENLKIKLA		QAKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як цикл трикарбонових кислот, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, НАДФ, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах.

Література

• Nekrutenko A., Hillis D.M., Patton J.C., Bradley R.D., Baker R.J. (1998). Cytosolic isocitrate dehydrogenase in humans, mice, and voles and phylogenetic analysis of the enzyme family. Mol. Biol. Evol. 15: 1674—1684. PMID 9866202 DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025894
• Geisbrecht B.V., Gould S.J. (1999). The human PICD gene encodes a cytoplasmic and peroxisomal NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenase. J. Biol. Chem. 274: 30527—30533. PMID 10521434 DOI:10.1074/jbc.274.43.30527
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2