IFIT3

IFIT3
Ідентифікатори
Символи	IFIT3, CIG-49, GARG-49, IFI60, IFIT4, IRG2, ISG60, P60, RIG-G, cig41, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604650 MGI: 1101055 HomoloGene: 1189 GeneCards: IFIT3
Онтологія гена Молекулярна функція • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • гіалоплазма Біологічний процес • процес імунної системи • response to virus • вроджений імунітет • negative regulation of apoptotic process • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to interferon-alpha • response to bacterium • cellular response to interferon-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3437	15959
Ensembl	ENSG00000119917	ENSMUSG00000074896
UniProt	O14879	Q64345
RefSeq (мРНК)	NM_001549 NM_001031683 NM_001289758 NM_001289759	NM_010501
RefSeq (білок)	NP_001026853 NP_001276687 NP_001276688 NP_001540	NP_034631
Локус (UCSC)	Хр. 10: 89.33 – 89.38 Mb	Хр. 19: 34.56 – 34.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFIT3 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 55 985.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEVTKNSLE		KILPQLKCHF		TWNLFKEDSV		SRDLEDRVCN		QIEFLNTEFK
ATMYNLLAYI		KHLDGNNEAA		LECLRQAEEL		IQQEHADQAE		IRSLVTWGNY
AWVYYHLGRL		SDAQIYVDKV		KQTCKKFSNP		YSIEYSELDC		EEGWTQLKCG
RNERAKVCFE		KALEEKPNNP		EFSSGLAIAM		YHLDNHPEKQ		FSTDVLKQAI
ELSPDNQYVK		VLLGLKLQKM		NKEAEGEQFV		EEALEKSPCQ		TDVLRSAAKF
YRRKGDLDKA		IELFQRVLES		TPNNGYLYHQ		IGCCYKAKVR		QMQNTGESEA
SGNKEMIEAL		KQYAMDYSNK		ALEKGLNPLN		AYSDLAEFLE		TECYQTPFNK
EVPDAEKQQS		HQRYCNLQKY		NGKSEDTAVQ		HGLEGLSISK		KSTDKEEIKD
QPQNVSENLL		PQNAPNYWYL		QGLIHKQNGD		LLQAAKCYEK		ELGRLLRDAP
SGIGSIFLSA		SELEDGSEEM		GQGAVSSSPR		ELLSNSEQLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• Zhu H., Cong J.-P., Shenk T. (1997). Use of differential display analysis to assess the effect of human cytomegalovirus infection on the accumulation of cellular RNAs: induction of interferon-responsive RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13985—13990. PMID 9391139 DOI:10.1073/pnas.94.25.13985
• de Veer M.J., Sim H., Whisstock J.C., Devenish R.J., Ralph S.J. (1998). IFI60/ISG60/IFIT4, a new member of the human IFI54/IFIT2 family of interferon-stimulated genes. Genomics. 54: 267—277. PMID 9828129 DOI:10.1006/geno.1998.5555
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Stawowczyk M., Van Scoy S., Kumar K.P., Reich N.C. (2011). The interferon stimulated gene 54 promotes apoptosis. J. Biol. Chem. 286: 7257—7266. PMID 21190939 DOI:10.1074/jbc.M110.207068
• Liu X.Y., Chen W., Wei B., Shan Y.F., Wang C. (2011). IFN-induced TPR protein IFIT3 potentiates antiviral signaling by bridging MAVS and TBK1. J. Immunol. 187: 2559—2568. PMID 21813773 DOI:10.4049/jimmunol.1100963
• Fensterl V., Sen G.C. (2011). The ISG56/IFIT1 gene family. J. Interferon Cytokine Res. 31: 71—78. PMID 20950130 DOI:10.1089/jir.2010.0101

Див. також

• Хромосома 10