IGSF11

IGSF11
Ідентифікатори
Символи	IGSF11, BT-IgSF, CT119, CXADRL1, Igsf13, VSIG3, immunoglobulin superfamily member 11, BTIGSF
Зовнішні ІД	OMIM: 608351 MGI: 2388477 HomoloGene: 17613 GeneCards: IGSF11
Онтологія гена Молекулярна функція • ionotropic glutamate receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell-cell junction • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення • excitatory synapse Біологічний процес • regulation of growth • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • maintenance of protein location • regulation of synaptic plasticity • positive regulation of mini excitatory postsynaptic potential • positive regulation of long-term synaptic potentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	152404	207683
Ensembl	ENSG00000144847	ENSMUSG00000022790
UniProt	Q5DX21	P0C673
RefSeq (мРНК)	NM_001015887 NM_152538 NM_001353318 NM_001353319 NM_001353320 NM_001353321 NM_001353322 NM_001353323 NM_001353324 NM_001353325 NM_001353326	NM_170599
RefSeq (білок)	NP_001015887 NP_689751 NP_001340247 NP_001340248 NP_001340249 NP_001340250 NP_001340251 NP_001340252 NP_001340253 NP_001340254 NP_001340255	NP_733548
Локус (UCSC)	Хр. 3: 118.9 – 119.15 Mb	Хр. 16: 38.71 – 38.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IGSF11 (англ. Immunoglobulin superfamily member 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 46 120.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSQRSPLAP		LLLLSLHGVA		ASLEVSESPG		SIQVARGQPA		VLPCTFTTSA
ALINLNVIWM		VTPLSNANQP		EQVILYQGGQ		MFDGAPRFHG		RVGFTGTMPA
TNVSIFINNT		QLSDTGTYQC		LVNNLPDIGG		RNIGVTGLTV		LVPPSAPHCQ
IQGSQDIGSD		VILLCSSEEG		IPRPTYLWEK		LDNTLKLPPT		ATQDQVQGTV
TIRNISALSS		GLYQCVASNA		IGTSTCLLDL		QVISPQPRNI		GLIAGAIGTG
AVIIIFCIAL		ILGAFFYWRS		KNKEEEEEEI		PNEIREDDLP		PKCSSAKAFH
TEISSSDNNT		LTSSNAYNSR		YWSNNPKVHR		NTESVSHFSD		LGQSFSFHSG
NANIPSIYAN		GTHLVPGQHK		TLVVTANRGS		SPQVMSRSNG		SVSRKPRPPH
THSYTISHAT		LERIGAVPVM		VPAQSRAGSL		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, регуляція росту, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Harada H., Suzu S., Hayashi Y., Okada S. (2005). BT-IgSF, a novel immunoglobulin superfamily protein, functions as a cell adhesion molecule. J. Cell. Physiol. 204: 919—926. PMID 15795899 DOI:10.1002/jcp.20361
• Katoh M., Katoh M. (2003). IGSF11 gene, frequently up-regulated in intestinal-type gastric cancer, encodes adhesion molecule homologous to CXADR, FLJ22415 and ESAM. Int. J. Oncol. 23: 525—531. PMID 12851705

Див. також

• Хромосома 3