IQSEC1

IQSEC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QWM, 4C0A
Ідентифікатори
Символи	IQSEC1, ARF-GEP100, ARFGEP100, BRAG2, GEP100, IQ motif and Sec7 domain 1, IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 1, IDDSSBA
Зовнішні ІД	OMIM: 610166 MGI: 1196356 HomoloGene: 82429 GeneCards: IQSEC1
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • lipid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of ARF protein signal transduction • actin cytoskeleton organization • positive regulation of keratinocyte migration • positive regulation of adherens junction organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9922	232227
Ensembl	ENSG00000144711	ENSMUSG00000034312
UniProt	Q6DN90	Q8R0S2
RefSeq (мРНК)	NM_001134382 NM_014869 NM_001330619 NM_001376938	NM_001134383 NM_001134384 NM_182784 NM_001356440
RefSeq (білок)	NP_001127854 NP_001317548 NP_055684 NP_001363867	NP_001127855 NP_001127856 NP_001343369
Локус (UCSC)	Хр. 3: 12.9 – 13.28 Mb	Хр. 6: 90.63 – 90.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IQSEC1 (англ. IQ motif and Sec7 domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 108 314.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWCLHCNSER		TQSLLELELD		SGVEGEAPSS		ETGTSLDSPS		AYPQGPLVPG
SSLSPDHYEH		TSVGAYGLYS		GPPGQQQRTR		RPKLQHSTSI		LRKQAEEEAI
KRSRSLSESY		ELSSDLQDKQ		VEMLERKYGG		RLVTRHAART		IQTAFRQYQM
NKNFERLRSS		MSENRMSRRI		VLSNMRMQFS		FEGPEKVHSS		YFEGKQVSVT
NDGSQLGALV		SPECGDLSEP		TTLKSPAPSS		DFADAITELE		DAFSRQVKSL
AESIDDALNC		RSLHTEEAPA		LDAARARDTE		PQTALHGMDH		RKLDEMTASY
SDVTLYIDEE		ELSPPLPLSQ		AGDRPSSTES		DLRLRAGGAA		PDYWALAHKE
DKADTDTSCR		STPSLERQEQ		RLRVEHLPLL		TIEPPSDSSV		DLSDRSERGS
LKRQSAYERS		LGGQQGSPKH		GPHSGAPKSL		PREEPELRPR		PPRPLDSHLA
INGSANRQSK		SESDYSDGDN		DSINSTSNSN		DTINCSSESS		SRDSLREQTL
SKQTYHKEAR		NSWDSPAFSN		DVIRKRHYRI		GLNLFNKKPE		KGVQYLIERG
FVPDTPVGVA		HFLLQRKGLS		RQMIGEFLGN		RQKQFNRDVL		DCVVDEMDFS
TMELDEALRK		FQAHIRVQGE		AQKVERLIEA		FSQRYCICNP		GVVRQFRNPD
TIFILAFAII		LLNTDMYSPN		VKPERKMKLE		DFIKNLRGVD		DGEDIPREML
MGIYERIRKR		ELKTNEDHVS		QVQKVEKLIV		GKKPIGSLHP		GLGCVLSLPH
RRLVCYCRLF		EVPDPNKPQK		LGLHQREIFL		FNDLLVVTKI		FQKKKNSVTY
SFRQSFSLYG		MQVLLFENQY		YPNGIRLTSS		VPGADIKVLI		NFNAPNPQDR
KKFTDDLRES		IAEVQEMEKH		RIESELEKQK		GVVRPSMSQC		SSLKKESGNG
TLSRACLDDS		YASGEGLKRS		ALSSSLRDLS		EAGKRGRRSS		AGSLESNVEF
QPFEPLQPSV		LCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3