IWS1

IWS1
Ідентифікатори
Символи	IWS1, SUPT6H interacting protein, interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1
Зовнішні ІД	MGI: 1920723 HomoloGene: 134421 GeneCards: IWS1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA transport • Сплайсинг РНК • regulation of histone H4 acetylation • regulation of mRNA processing • mRNA processing • regulation of mRNA export from nucleus • regulation of histone H3-K36 trimethylation • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • regulation of DNA-templated transcription, elongation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55677	73473
Ensembl	ENSG00000163166	ENSMUSG00000024384
UniProt	Q96ST2	Q8C1D8
RefSeq (мРНК)	NM_017969	NM_173441
RefSeq (білок)	NP_060439	NP_775617
Локус (UCSC)	Хр. 2: 127.44 – 127.53 Mb	Хр. 18: 32.2 – 32.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IWS1 (англ. IWS1, SUPT6H interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 819 амінокислот, а молекулярна маса — 91 955.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSEYYSGDQ		SDDGGATPVQ		DERDSGSDGE		DDVNEQHSGS		DTGSVERHSE
NETSDREDGL		PKGHHVTDSE		NDEPLNLNAS		DSESEELHRQ		KDSDSESEER
AEPPASDSEN		EDVNQHGSDS		ESEETRKLPG		SDSENEELLN		GHASDSENED
VGKHPASDSE		IEELQKSPAS		DSETEDALKP		QISDSESEEP		PRHQASDSEN
EEPPKPRMSD		SESEELPKPQ		VSDSESEEPP		RHQASDSENE		ELPKPRISDS
ESEDPPRHQA		SDSENEELPK		PRISDSESED		PPRNQASDSE		NEELPKPRVS
DSESEGPQKG		PASDSETEDA		SRHKQKPESD		DDSDRENKGE		DTEMQNDSFH
SDSHMDRKKF		HSSDSEEEEH		KKQKMDSDED		EKEGEEEKVA		KRKAAVLSDS
EDEEKASAKK		SRVVSDADDS		DSDAVSDKSG		KREKTIASDS		EEEAGKELSD
KKNEEKDLFG		SDSESGNEEE		NLIADIFGES		GDEEEEEFTG		FNQEDLEEEK
GETQVKEAED		SDSDDNIKRG		KHMDFLSDFE		MMLQRKKSMS		GKRRRNRDGG
TFISDADDVV		SAMIVKMNEA		AEEDRQLNNQ		KKPALKKLTL		LPAVVMHLKK
QDLKETFIDS		GVMSAIKEWL		SPLPDRSLPA		LKIREELLKI		LQELPSVSQE
TLKHSGIGRA		VMYLYKHPKE		SRSNKDMAGK		LINEWSRPIF		GLTSNYKGMT
REEREQRDLE		QMPQRRRMNS		TGGQTPRRDL		EKVLTGEEKA		LRPGDPGFCA
RARVPMPSNK		DYVVRPKWNV		EMESSRFQAT		SKKGISRLDK		QMRKFTDIRK
KSRSAHAVKI		SIEGNKMPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Liu Z., Zhou Z., Chen G., Bao S. (2007). A putative transcriptional elongation factor hIws1 is essential for mammalian cell proliferation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 353: 47—53. PMID 17184735 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.11.133
• Yoh S.M., Cho H., Pickle L., Evans R.M., Jones K.A. (2007). The Spt6 SH2 domain binds Ser2-P RNAPII to direct Iws1-dependent mRNA splicing and export. Genes Dev. 21: 160—174. PMID 17234882 DOI:10.1101/gad.1503107
• Yoh S.M., Lucas J.S., Jones K.A. (2008). The Iws1:Spt6:CTD complex controls cotranscriptional mRNA biosynthesis and HYPB/Setd2-mediated histone H3K36 methylation. Genes Dev. 22: 3422—3434. PMID 19141475 DOI:10.1101/gad.1720008
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 2