KATNA1

KATNA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RPA
Ідентифікатори
Символи	KATNA1, katanin catalytic subunit A1
Зовнішні ІД	OMIM: 606696 MGI: 1344353 HomoloGene: 56014 GeneCards: KATNA1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • microtubule binding • microtubule-severing ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • isomerase activity Клітинна компонента • цитоплазма • spindle pole • midbody • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • веретено поділу • mitotic spindle pole • центросома Біологічний процес • поділ клітини • microtubule severing • клітинний цикл • cytoplasmic microtubule organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11104	23924
Ensembl	ENSG00000186625	ENSMUSG00000019794
UniProt	O75449	Q9WV86
RefSeq (мРНК)	NM_001204076 NM_007044	NM_011835
RefSeq (білок)	NP_001191005 NP_008975	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 149.59 – 149.65 Mb	Хр. 10: 7.6 – 7.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KATNA1 (англ. Katanin catalytic subunit A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 55 965.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLLMISENV		KLAREYALLG		NYDSAMVYYQ		GVLDQMNKYL		YSVKDTYLQQ
KWQQVWQEIN		VEAKHVKDIM		KTLESFKLDS		TPLKAAQHDL		PASEGEVWSM
PVPVERRPSP		GPRKRQSSQY		SDPKSHGNRP		STTVRVHRSS		AQNVHNDRGK
AVRCREKKEQ		NKGREEKNKS		PAAVTEPETN		KFDSTGYDKD		LVEALERDII
SQNPNVRWDD		IADLVEAKKL		LKEAVVLPMW		MPEFFKGIRR		PWKGVLMVGP
PGTGKTLLAK		AVATECKTTF		FNVSSSTLTS		KYRGESEKLV		RLLFEMARFY
SPATIFIDEI		DSICSRRGTS		EEHEASRRVK		AELLVQMDGV		GGTSENDDPS
KMVMVLAATN		FPWDIDEALR		RRLEKRIYIP		LPSAKGREEL		LRISLRELEL
ADDVDLASIA		ENMEGYSGAD		ITNVCRDASL		MAMRRRIEGL		TPEEIRNLSK
EEMHMPTTME		DFEMALKKVS		KSVSAADIER		YEKWIFEFGS		C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• McNally F.J., Thomas S. (1998). Katanin is responsible for the M-phase microtubule-severing activity in Xenopus eggs. Mol. Biol. Cell. 9: 1847—1861. PMID 9658175 DOI:10.1091/mbc.9.7.1847
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cummings C.M., Bentley C.A., Perdue S.A., Baas P.W., Singer J.D. (2009). The Cul3/Klhdc5 E3 ligase regulates p60/katanin and is required for normal mitosis in mammalian cells. J. Biol. Chem. 284: 11663—11675. PMID 19261606 DOI:10.1074/jbc.M809374200
• Maddika S., Chen J. (2009). Protein kinase DYRK2 is a scaffold that facilitates assembly of an E3 ligase. Nat. Cell Biol. 11: 409—419. PMID 19287380 DOI:10.1038/ncb1848
• McNally K.P., Bazirgan O.A., McNally F.J. (2000). Two domains of p80 katanin regulate microtubule severing and spindle pole targeting by p60 katanin. J. Cell Sci. 113: 1623—1633. PMID 10751153
• Buster D., McNally K., McNally F.J. (2002). Katanin inhibition prevents the redistribution of gamma-tubulin at mitosis. J. Cell Sci. 115: 1083—1092. PMID 11870226

Див. також

• Хромосома 6