KDM3A

KDM3A
Ідентифікатори
Символи	KDM3A, JHDM2A, JHMD2A, JMJD1, JMJD1A, TSGA, lysine demethylase 3A
Зовнішні ІД	OMIM: 611512 MGI: 98847 HomoloGene: 10196 GeneCards: KDM3A
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • androgen receptor binding • oxidoreductase activity • histone demethylase activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • chromatin DNA binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • Хроматин Біологічний процес • androgen receptor signaling pathway • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 dimethylation • regulation of stem cell differentiation • regulation of stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Сперматогенез • hormone-mediated signaling pathway • negative regulation of histone H3-K9 methylation • регуляція експресії генів • formaldehyde biosynthetic process • spermatid nucleus elongation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K9 demethylation • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55818	104263
Ensembl	ENSG00000115548	ENSMUSG00000053470
UniProt	Q9Y4C1	Q6PCM1
RefSeq (мРНК)	NM_001146688 NM_018433	NM_001038695 NM_173001 NM_001362200 NM_001362201
RefSeq (білок)	NP_001140160 NP_060903	NP_001033784 NP_766589 NP_001349129 NP_001349130
Локус (UCSC)	Хр. 2: 86.44 – 86.49 Mb	Хр. 6: 71.57 – 71.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KDM3A (англ. Lysine demethylase 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 321 амінокислот, а молекулярна маса — 147 341.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLTLGESWP		VLVGRRFLSL		SAADGSDGSH		DSWDVERVAE		WPWLSGTIRA
VSHTDVTKKD		LKVCVEFDGE		SWRKRRWIEV		YSLLRRAFLV		EHNLVLAERK
SPEISERIVQ		WPAITYKPLL		DKAGLGSITS		VRFLGDQQRV		FLSKDLLKPI
QDVNSLRLSL		TDNQIVSKEF		QALIVKHLDE		SHLLKGDKNL		VGSEVKIYSL
DPSTQWFSAT		VINGNPASKT		LQVNCEEIPA		LKIVDPSLIH		VEVVHDNLVT
CGNSARIGAV		KRKSSENNGT		LVSKQAKSCS		EASPSMCPVQ		SVPTTVFKEI
LLGCTAATPP		SKDPRQQSTP		QAANSPPNLG		AKIPQGCHKQ		SLPEEISSCL
NTKSEALRTK		PDVCKAGLLS		KSSQIGTGDL		KILTEPKGSC		TQPKTNTDQE
NRLESVPQAL		TGLPKECLPT		KASSKAELEI		ANPPELQKHL		EHAPSPSDVS
NAPEVKAGVN		SDSPNNCSGK		KVEPSALACR		SQNLKESSVK		VDNESCCSRS
NNKIQNAPSR		KSVLTDPAKL		KKLQQSGEAF		VQDDSCVNIV		AQLPKCRECR
LDSLRKDKEQ		QKDSPVFCRF		FHFRRLQFNK		HGVLRVEGFL		TPNKYDNEAI
GLWLPLTKNV		VGIDLDTAKY		ILANIGDHFC		QMVISEKEAM		STIEPHRQVA
WKRAVKGVRE		MCDVCDTTIF		NLHWVCPRCG		FGVCVDCYRM		KRKNCQQGAA
YKTFSWLKCV		KSQIHEPENL		MPTQIIPGKA		LYDVGDIVHS		VRAKWGIKAN
CPCSNRQFKL		FSKPASKEDL		KQTSLAGEKP		TLGAVLQQNP		SVLEPAAVGG
EAASKPAGSM		KPACPASTSP		LNWLADLTSG		NVNKENKEKQ		PTMPILKNEI
KCLPPLPPLS		KSSTVLHTFN		STILTPVSNN		NSGFLRNLLN		SSTGKTENGL
KNTPKILDDI		FASLVQNKTT		SDLSKRPQGL		TIKPSILGFD		TPHYWLCDNR
LLCLQDPNNK		SNWNVFRECW		KQGQPVMVSG		VHHKLNSELW		KPESFRKEFG
EQEVDLVNCR		TNEIITGATV		GDFWDGFEDV		PNRLKNEKEP		MVLKLKDWPP
GEDFRDMMPS		RFDDLMANIP		LPEYTRRDGK		LNLASRLPNY		FVRPDLGPKM
YNAYGLITPE		DRKYGTTNLH		LDVSDAANVM		VYVGIPKGQC		EQEEEVLKTI
QDGDSDELTI		KRFIEGKEKP		GALWHIYAAK		DTEKIREFLK		KVSEEQGQEN
PADHDPIHDQ		SWYLDRSLRK		RLHQEYGVQG		WAIVQFLGDV		VFIPAGAPHQ
VHNLYSCIKV		AEDFVSPEHV		KHCFWLTQEF		RYLSQTHTNH		EDKLQVKNVI
YHAVKDAVAM		LKASESSFGK		P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, сперматогенез, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Див. також

• Хромосома 2