KLHL20

KLHL20
Ідентифікатори
Символи	KLHL20, KHLHX, KLEIP, KLHLX, kelch like family member 20
Зовнішні ІД	OMIM: 617679 MGI: 2444855 HomoloGene: 8699 GeneCards: KLHL20
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • interferon-gamma binding • actin binding Клітинна компонента • клітинне ядро • cell projection • actin cytoskeleton • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • perinuclear region of cytoplasm • дендрит (нейробіологія) • trans-Golgi network • аксон • цитоплазма • комплекс Ґольджі • PML body • гіалоплазма Біологічний процес • Golgi to endosome transport • protein K33-linked ubiquitination • cytoskeleton organization • protein transport • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to interferon-alpha • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of apoptotic process • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27252	226541
Ensembl	ENSG00000076321	ENSMUSG00000026705
UniProt	Q9Y2M5	Q8VCK5
RefSeq (мРНК)	NM_014458	NM_001039482 NM_144876
RefSeq (білок)	NP_055273	NP_001034571
Локус (UCSC)	Хр. 1: 173.71 – 173.79 Mb	Хр. 1: 160.92 – 160.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KLHL20 (англ. Kelch like family member 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 67 955.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGKPMRRCT		NIRPGETGMD		VTSRCTLGDP		NKLPEGVPQP		ARMPYISDKH
PRQTLEVINL		LRKHRELCDV		VLVVGAKKIY		AHRVILSACS		PYFRAMFTGE
LAESRQTEVV		IRDIDERAME		LLIDFAYTSQ		ITVEEGNVQT		LLPAACLLQL
AEIQEACCEF		LKRQLDPSNC		LGIRAFADTH		SCRELLRIAD		KFTQHNFQEV
MESEEFMLLP		ANQLIDIISS		DELNVRSEEQ		VFNAVMAWVK		YSIQERRPQL
PQVLQHVRLP		LLSPKFLVGT		VGSDPLIKSD		EECRDLVDEA		KNYLLLPQER
PLMQGPRTRP		RKPIRCGEVL		FAVGGWCSGD		AISSVERYDP		QTNEWRMVAS
MSKRRCGVGV		SVLDDLLYAV		GGHDGSSYLN		SVERYDPKTN		QWSSDVAPTS
TCRTSVGVAV		LGGFLYAVGG		QDGVSCLNIV		ERYDPKENKW		TRVASMSTRR
LGVAVAVLGG		FLYAVGGSDG		TSPLNTVERY		NPQENRWHTI		APMGTRRKHL
GCAVYQDMIY		AVGGRDDTTE		LSSAERYNPR		TNQWSPVVAM		TSRRSGVGLA
VVNGQLMAVG		GFDGTTYLKT		IEVFDPDANT		WRLYGGMNYR		RLGGGVGVIK
MTHCESHIW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Furukawa M., He Y.J., Borchers C., Xiong Y. (2003). Targeting of protein ubiquitination by BTB-Cullin 3-Roc1 ubiquitin ligases. Nat. Cell Biol. 5: 1001—1007. PMID 14528312 DOI:10.1038/ncb1056
• Lin M.Y., Lin Y.M., Kao T.C., Chuang H.H., Chen R.H. (2011). PDZ-RhoGEF ubiquitination by Cullin3-KLHL20 controls neurotrophin-induced neurite outgrowth. J. Cell Biol. 193: 985—994. PMID 21670212 DOI:10.1083/jcb.201103015

Див. також

• Хромосома 1