LARP6

LARP6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MTF, 2MTG
Ідентифікатори
Символи	LARP6, ACHN, La ribonucleoprotein domain family member 6, La ribonucleoprotein 6, translational regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 611300 MGI: 1914807 HomoloGene: 32408 GeneCards: LARP6
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific mRNA binding • myosin binding • RNA stem-loop binding • mRNA 5'-UTR binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • Полісома • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • regulation of translation • positive regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of translation • positive regulation of mRNA binding Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55323	67557
Ensembl	ENSG00000166173	ENSMUSG00000034839
UniProt	Q9BRS8	Q8BN59
RefSeq (мРНК)	NM_197958 NM_001286679 NM_018357	NM_026235
RefSeq (білок)	NP_001273608 NP_060827 NP_932062	NP_080511
Локус (UCSC)	Хр. 15: 70.83 – 70.85 Mb	Хр. 9: 60.62 – 60.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LARP6 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 54 737.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQSGGEARP		GPKTAVQIRV		AIQEAEDVDE		LEDEEEGAET		RGAGDPARYL
SPGWGSASEE		EPSRGHSGTT		ASGGENERED		LEQEWKPPDE		ELIKKLVDQI
EFYFSDENLE		KDAFLLKHVR		RNKLGYVSVK		LLTSFKKVKH		LTRDWRTTAH
ALKYSVVLEL		NEDHRKVRRT		TPVPLFPNEN		LPSKMLLVYD		LYLSPKLWAL
ATPQKNGRVQ		EKVMEHLLKL		FGTFGVISSV		RILKPGRELP		PDIRRISSRY
SQVGTQECAI		VEFEEVEAAI		KAHEFMITES		QGKENMKAVL		IGMKPPKKKP
AKDKNHDEEP		TASIHLNKSL		NKRVEELQYM		GDESSANSSS		DPESNPTSPM
AGRRHAATNK		LSPSGHQNLF		LSPNASPCTS		PWSSPLAQRK		GVSRKSPLAE
EGRLNCSTSP		EIFRKCMDYS		SDSSVTPSGS		PWVRRRRQAE		MGTQEKSPGT
SPLLSRKMQT		ADGLPVGVLR		LPRGPDNTRG		FHGHERSRAC		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Valavanis C., Wang Z., Sun D., Vaine M., Schwartz L.M. (2007). Acheron, a novel member of the Lupus antigen family, is induced during the programmed cell death of skeletal muscles in the moth Manduca sexta. Gene. 393: 101—109. PMID 17383118 DOI:10.1016/j.gene.2007.01.033
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cai L., Fritz D., Stefanovic L., Stefanovic B. (2010). Nonmuscle myosin-dependent synthesis of type I collagen. J. Mol. Biol. 401: 564—578. PMID 20603131 DOI:10.1016/j.jmb.2010.06.057
• Challa A.A., Stefanovic B. (2011). A novel role of vimentin filaments: binding and stabilization of collagen mRNAs. Mol. Cell. Biol. 31: 3773—3789. PMID 21746880 DOI:10.1128/MCB.05263-11
• Manojlovic Z., Stefanovic B. (2012). A novel role of RNA helicase A in regulation of translation of type I collagen mRNAs. RNA. 18: 321—334. PMID 22190748 DOI:10.1261/rna.030288.111

Див. також

• Хромосома 15