LDB1

LDB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XJY, 2XJZ, 2YPA
Ідентифікатори
Символи	LDB1, CLIM2, NLI, CLIM-2, LDB-1, LIM domain binding 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603451 MGI: 894762 HomoloGene: 2891 GeneCards: LDB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • LIM domain binding; • chromatin binding; • protein self-association; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • enzyme binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • клітинне ядро; • cell leading edge; • нуклеоплазма; • beta-catenin-TCF complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• hair follicle development; • transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery; • epithelial structure maintenance; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process; • somatic stem cell population maintenance; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • gastrulation with mouth forming second; • cerebellar Purkinje cell differentiation; • regulation of DNA-templated transcription, elongation; • head development; • histone H3-K4 acetylation; • Wnt signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cerebellum development; • negative regulation of erythrocyte differentiation; • multicellular organism development; • neuron differentiation; • anterior/posterior axis specification; • cellular component assembly; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of cell adhesion; • regulation of focal adhesion assembly; • regulation of cell migration; • regulation of kinase activity; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8861
	16825
	ENSG00000198728
	ENSMUSG00000025223
	Q86U70
	P70662
	NM_001113407; NM_003893; NM_001321612
	NM_001113408; NM_010697; NM_001360336
	NP_001106878; NP_001308541; NP_003884
	NP_001106879; NP_034827; NP_001347265
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LDB1 (англ. LIM domain binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 533^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVGCACPGC	SSKSFKLYSP	KEPPNGNAFP	PFHPGTMLDR	DVGPTPMYPP
TYLEPGIGRH	TPYGNQTDYR	IFELNKRLQN	WTEECDNLWW	DAFTTEFFED
DAMLTITFCL	EDGPKRYTIG	RTLIPRYFRS	IFEGGATELY	YVLKHPKEAF
HSNFVSLDCD	QGSMVTQHGK	PMFTQVCVEG	RLYLEFMFDD	MMRIKTWHFS
IRQHRELIPR	SILAMHAQDP	QMLDQLSKNI	TRCGLSNSTL	NYLRLCVILE
PMQELMSRHK	TYSLSPRDCL	KTCLFQKWQR	MVAPPAEPTR	QQPSKRRKRK
MSGGSTMSSG	GGNTNNSNSK	KKSPASTFAL	SSQVPDVMVV	GEPTLMGGEF
GDEDERLITR	LENTQFDAAN	GIDDEDSFNN	SPALGANSPW	NSKPPSSQES
KSENPTSQAS	Q

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Semina E.V., Altherr M.R., Murray J.C. (1998). Cloning and chromosomal localization of two novel human genes encoding LIM-domain binding factors CLIM1 and CLIM2/LDB1/NLI. Mamm. Genome. 9: 921—924. PMID 9799849 DOI:10.1007/s003359900899
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6532 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q86U70 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6532 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q86U70 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

LDB1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук