LHX9

LHX9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DMQ
Ідентифікатори
Символи	LHX9, LIM homeobox 9
Зовнішні ІД	OMIM: 606066 MGI: 1316721 HomoloGene: 7816 GeneCards: LHX9
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • проліферація • male gonad development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • female gonad development • gonad morphogenesis • dorsal spinal cord interneuron anterior axon guidance • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56956	16876
Ensembl	ENSG00000143355	ENSMUSG00000019230
UniProt	Q9NQ69	Q9WUH2
RefSeq (мРНК)	NM_001014434 NM_020204 NM_001370213	NM_001025565 NM_001042577 NM_010714
RefSeq (білок)	NP_001014434 NP_064589 NP_001357142	NP_001020736 NP_001036042 NP_034844
Локус (UCSC)	Хр. 1: 197.91 – 197.94 Mb	Хр. 1: 138.83 – 138.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LHX9 (англ. LIM homeobox 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 43 976.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEIVGCRAED		NSCPFRPPAM		LFHGISGGHI		QGIMEEMERR		SKTEARLAKG
AQLNGRDAGM		PPLSPEKPAL		CAGCGGKISD		RYYLLAVDKQ		WHLRCLKCCE
CKLALESELT		CFAKDGSIYC		KEDYYRRFSV		QRCARCHLGI		SASEMVMRAR
DSVYHLSCFT		CSTCNKTLTT		GDHFGMKDSL		VYCRAHFETL		LQGEYPPQLS
YTELAAKSGG		LALPYFNGTG		TVQKGRPRKR		KSPALGVDIV		NYNSGCNENE
ADHLDRDQQP		YPPSQKTKRM		RTSFKHHQLR		TMKSYFAINH		NPDAKDLKQL
AQKTGLTKRV		LQVWFQNARA		KFRRNLLRQE		NGGVDKADGT		SLPAPPSADS
GALTPPGTAT		TLTDLTNPTI		TVVTSVTSNM		DSHESGSPSQ		TTLTNLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1