LIMS2

LIMS2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3IXE
Ідентифікатори
Символи	LIMS2, PINCH-2, PINCH2, LGMD2W, LIM zinc finger domain containing 2, MDRCMTT
Зовнішні ІД	OMIM: 607908 MGI: 2385067 HomoloGene: 41214 GeneCards: LIMS2
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера, autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2W
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • гіалоплазма • Міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • cell-cell junction Біологічний процес • positive regulation of integrin-mediated signaling pathway • negative regulation of neural precursor cell proliferation • cell-cell junction organization • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of hepatocyte proliferation • cell junction assembly • negative regulation of epithelial cell proliferation • cell-cell adhesion • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55679	225341
Ensembl	ENSG00000072163	ENSMUSG00000024395
UniProt	Q7Z4I7	Q91XD2
RefSeq (мРНК)	NM_001136037 NM_001161403 NM_001161404 NM_001256542 NM_017980	NM_144862 NM_001365015 NM_001379137 NM_001379138
RefSeq (білок)	NP_001129509 NP_001154875 NP_001154876 NP_001243471 NP_060450	NP_659111 NP_001351944 NP_001366066 NP_001366067
Локус (UCSC)	Хр. 2: 127.64 – 127.68 Mb	Хр. 18: 32.06 – 32.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LIMS2 (англ. LIM zinc finger domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 38 916.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTGSNMSDAL		ANAVCQRCQA		RFSPAERIVN		SNGELYHEHC		FVCAQCFRPF
PEGLFYEFEG		RKYCEHDFQM		LFAPCCGSCG		EFIIGRVIKA		MNNNWHPGCF
RCELCDVELA		DLGFVKNAGR		HLCRPCHNRE		KAKGLGKYIC		QRCHLVIDEQ
PLMFRSDAYH		PDHFNCTHCG		KELTAEAREL		KGELYCLPCH		DKMGVPICGA
CRRPIEGRVV		NALGKQWHVE		HFVCAKCEKP		FLGHRHYEKK		GLAYCETHYN
QLFGDVCYNC		SHVIEGDVVS		ALNKAWCVSC		FSCSTCNSKL		TLKNKFVEFD
MKPVCKRCYE		KFPLELKKRL		KKLSELTSRK		AQPKATDLNS		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Zhang Y., Chen K., Guo L., Wu C. (2002). Characterization of PINCH-2, a new focal adhesion protein that regulates the PINCH-1-ILK interaction, cell spreading, and migration. J. Biol. Chem. 277: 38328—38338. PMID 12167643 DOI:10.1074/jbc.M205576200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2