LRRC8A

LRRC8A
Ідентифікатори
Символи	LRRC8A, AGM5, LRRC8, SWELL1, leucine-rich repeat containing 8 family member A, leucine rich repeat containing 8 family member A, leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit A, HsLRRC8A
Зовнішні ІД	OMIM: 608360 MGI: 2652847 HomoloGene: 18617 GeneCards: LRRC8A
Онтологія гена Молекулярна функція • anion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • volume-sensitive anion channel activity • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • іонні канали • мембрана • цитоплазма • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • pre-B cell differentiation • response to osmotic stress • cell volume homeostasis • диференціація клітин • ion transport • anion transport • regulation of anion transport • anion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт • inorganic anion transport • taurine transport • aspartate transmembrane transport • protein hexamerization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56262	241296
Ensembl	ENSG00000136802	ENSMUSG00000007476
UniProt	Q8IWT6	Q80WG5
RefSeq (мРНК)	NM_001127244 NM_001127245 NM_019594	NM_177725
RefSeq (білок)	NP_001120716 NP_001120717 NP_062540	NP_808393
Локус (UCSC)	Хр. 9: 128.88 – 128.92 Mb	Хр. 2: 30.13 – 30.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRRC8A (англ. Leucine rich repeat containing 8 family member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 810 амінокислот, а молекулярна маса — 94 199.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIPVTELRYF		ADTQPAYRIL		KPWWDVFTDY		ISIVMLMIAV		FGGTLQVTQD
KMICLPCKWV		TKDSCNDSFR		GWAAPGPEPT		YPNSTILPTP		DTGPTGIKYD
LDRHQYNYVD		AVCYENRLHW		FAKYFPYLVL		LHTLIFLACS		NFWFKFPRTS
SKLEHFVSIL		LKCFDSPWTT		RALSETVVEE		SDPKPAFSKM		NGSMDKKSST
VSEDVEATVP		MLQRTKSRIE		QGIVDRSETG		VLDKKEGEQA		KALFEKVKKF
RTHVEEGDIV		YRLYMRQTII		KVIKFILIIC		YTVYYVHNIK		FDVDCTVDIE
SLTGYRTYRC		AHPLATLFKI		LASFYISLVI		FYGLICMYTL		WWMLRRSLKK
YSFESIREES		SYSDIPDVKN		DFAFMLHLID		QYDPLYSKRF		AVFLSEVSEN
KLRQLNLNNE		WTLDKLRQRL		TKNAQDKLEL		HLFMLSGIPD		TVFDLVELEV
LKLELIPDVT		IPPSIAQLTG		LKELWLYHTA		AKIEAPALAF		LRENLRALHI
KFTDIKEIPL		WIYSLKTLEE		LHLTGNLSAE		NNRYIVIDGL		RELKRLKVLR
LKSNLSKLPQ		VVTDVGVHLQ		KLSINNEGTK		LIVLNSLKKM		ANLTELELIR
CDLERIPHSI		FSLHNLQEID		LKDNNLKTIE		EIISFQHLHR		LTCLKLWYNH
IAYIPIQIGN		LTNLERLYLN		RNKIEKIPTQ		LFYCRKLRYL		DLSHNNLTFL
PADIGLLQNL		QNLAITANRI		ETLPPELFQC		RKLRALHLGN		NVLQSLPSRV
GELTNLTQIE		LRGNRLECLP		VELGECPLLK		RSGLVVEEDL		FNTLPPEVKE
RLWRADKEQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, диференціація клітин, ацетилювання. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Smits G., Kajava A.V. (2004). LRRC8 extracellular domain is composed of 17 leucine-rich repeats. Mol. Immunol. 41: 561—562. PMID 15183935 DOI:10.1016/j.molimm.2004.04.001
• Abascal F., Zardoya R. (2012). LRRC8 proteins share a common ancestor with pannexins, and may form hexameric channels involved in cell-cell communication. Bioessays. 34: 551—560. PMID 22532330 DOI:10.1002/bies.201100173
• Lee C.C., Freinkman E., Sabatini D.M., Ploegh H.L. (2014). The protein synthesis inhibitor blasticidin S enters mammalian cells via leucine-rich repeat-containing protein 8D. J. Biol. Chem. 289: 17124—17131. PMID 24782309 DOI:10.1074/jbc.M114.571257

Див. також

• Хромосома 9