LSM7

LSM7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JCR
Ідентифікатори
Символи	LSM7, YNL147W, LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
Зовнішні ІД	OMIM: 607287 MGI: 1913344 HomoloGene: 6781 GeneCards: LSM7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • U6 snRNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal tri-snRNP complex • U6 snRNP • U12-type spliceosomal complex • нуклеоплазма • Lsm1-7-Pat1 complex • spliceosomal complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome • Lsm2-8 complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сплайсинг РНК • nuclear-transcribed mRNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51690	66094
Ensembl	ENSG00000130332	ENSMUSG00000035215
UniProt	Q9UK45	Q9CQQ8
RefSeq (мРНК)	NM_016199	NM_025349 NM_001359148 NM_001359149 NM_001359150
RefSeq (білок)	NP_057283	NP_079625 NP_001346077 NP_001346078 NP_001346079
Локус (UCSC)	Хр. 19: 2.32 – 2.33 Mb	Хр. 10: 80.69 – 80.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LSM7 (англ. LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 103 амінокислот, а молекулярна маса — 11 602.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADKEKKKKE		SILDLSKYID		KTIRVKFQGG		REASGILKGF		DPLLNLVLDG
TIEYMRDPDD		QYKLTEDTRQ		LGLVVCRGTS		VVLICPQDGM		EAIPNPFIQQ
QDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19