LSP1

LSP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BH8, 4NO0, 4NO2
Ідентифікатори
Символи	LSP1, WP34, pp52, lymphocyte-specific protein 1, lymphocyte specific protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 153432 MGI: 96832 HomoloGene: 1750 GeneCards: LSP1
Пов'язані генетичні захворювання
рак сечового міхура, неспецифічний виразковий коліт
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • signal transducer activity Клітинна компонента • екзосома • actin cytoskeleton • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • хемотаксис • cellular defense response • defense response • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4046	16985
Ensembl	ENSG00000130592 ENSG00000288199	ENSMUSG00000018819
UniProt	P33241	P19973
RefSeq (мРНК)	NM_002339 NM_001013253 NM_001013254 NM_001013255 NM_001242932 NM_001289005	NM_001136071 NM_001271508 NM_001271509 NM_001271510 NM_001271523 NM_019391
RefSeq (білок)	NP_001013271 NP_001013272 NP_001013273 NP_001229861 NP_001275934 NP_002330	NP_001129543 NP_001258437 NP_001258438 NP_001258439 NP_001258452 NP_062264
Локус (UCSC)	Хр. 11: 1.85 – 1.89 Mb	Хр. 7: 142.01 – 142.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LSP1 (англ. Lymphocyte-specific protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 192.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEASSDPGA		EEREELLGPT		AQWSVEDEEE		AVHEQCQHER		DRQLQAQDEE
GGGHVPERPK		QEMLLSLKPS		EAPELDEDEG		FGDWSQRPEQ		RQQHEGAQGA
LDSGEPPQCR		SPEGEQEDRP		GLHAYEKEDS		DEVHLEELSL		SKEGPGPEDT
VQDNLGAAGA		EEEQEEHQKC		QQPRTPSPLV		LEGTIEQSSP		PLSPTTKLID
RTESLNRSIE		KSNSVKKSQP		DLPISKIDQW		LEQYTQAIET		AGRTPKLARQ
ASIELPSMAV		ASTKSRWETG		EVQAQSAAKT		PSCKDIVAGD		MSKKSLWEQK
GGSKTSSTIK		STPSGKRYKF		VATGHGKYEK		VLVEGGPAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Kadiyala R.K., McIntyre B.W., Krensky A.M. (1990). Molecular cloning and characterization of WP34, a phosphorylated human lymphocyte differentiation and activation antigen. Eur. J. Immunol. 20: 2417—2423. PMID 2174784 DOI:10.1002/eji.1830201109
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Jongstra-Bilen J., Young A.J., Chong R., Jongstra J. (1990). Human and mouse LSP1 genes code for highly conserved phosphoproteins. J. Immunol. 144: 1104—1110. PMID 2295815
• Howard T., Li Y., Torres M., Guerrero A., Coates T. (1994). The 47-kD protein increased in neutrophil actin dysfunction with 47- and 89-kD protein abnormalities is lymphocyte-specific protein. Blood. 83: 231—241. PMID 8274738

Див. також

• Хромосома 11