LYAR

LYAR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WJV
Ідентифікатори
Символи	LYAR, ZC2HC2, ZLy1 antibody reactive
Зовнішні ІД	OMIM: 617684 MGI: 107470 HomoloGene: 41200 GeneCards: LYAR
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • photoreceptor outer segment • цитоплазма • cell projection Біологічний процес • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • rRNA processing • erythrocyte development • positive regulation of phagocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55646	17089
Ensembl	ENSG00000145220	ENSMUSG00000067367
UniProt	Q9NX58	Q08288
RefSeq (мРНК)	NM_001145725 NM_017816	NM_025281
RefSeq (білок)	NP_001139197 NP_060286	NP_079557
Локус (UCSC)	Хр. 4: 4.27 – 4.29 Mb	Хр. 5: 38.38 – 38.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LYAR (англ. Ly1 antibody reactive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 43 615.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVFFTCNACG		ESVKKIQVEK		HVSVCRNCEC		LSCIDCGKDF		WGDDYKNHVK
CISEDQKYGG		KGYEGKTHKG		DIKQQAWIQK		ISELIKRPNV		SPKVRELLEQ
ISAFDNVPRK		KAKFQNWMKN		SLKVHNESIL		DQVWNIFSEA		SNSEPVNKEQ
DQRPLHPVAN		PHAEISTKVP		ASKVKDAVEQ		QGEVKKNKRE		RKEERQKKRK
REKKELKLEN		HQENSRNQKP		KKRKKGQEAD		LEAGGEEVPE		ANGSAGKRSK
KKKQRKDSAS		EEEAHVGAGK		RKRRHSEVET		DSKKKKMKLP		EHPEGGEPED
DEAPAKGKFN		WKGTIKAILK		QAPDNEITIK		KLRKKVLAQY		YTVTDEHHRS
EEELLVIFNK		KISKNPTFKL		LKDKVKLVK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4