MAGOHB

MAGOHB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P27, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2XB2, 3EX7
Ідентифікатори
Символи	MAGOHB, MGN2, mago, magoh, mago homolog B, exon junction complex core component, mago homolog B, exon junction complex subunit
Зовнішні ІД	MGI: 1913691 HomoloGene: 56794 GeneCards: MAGOHB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • neuronal cell body • catalytic step 2 spliceosome • exon-exon junction complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 1 spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • mRNA transport • Сплайсинг РНК • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55110	66441
Ensembl	ENSG00000111196	ENSMUSG00000030188
UniProt	Q96A72	Q9CQL1
RefSeq (мРНК)	NM_001300739 NM_018048 NM_001319985	NM_025564 NM_001327860
RefSeq (білок)	NP_001287668 NP_001306914 NP_060518	NP_001314789 NP_079840
Локус (UCSC)	Хр. 12: 10.6 – 10.61 Mb	Хр. 6: 131.26 – 131.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MAGOHB (англ. Mago homolog B, exon junction complex core component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 148 амінокислот, а молекулярна маса — 17 276.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVASDFYLR		YYVGHKGKFG		HEFLEFEFRP		DGKLRYANNS		NYKNDVMIRK
EAYVHKSVME		ELKRIIDDSE		ITKEDDALWP		PPDRVGRQEL		EIVIGDEHIS
FTTSKIGSLI		DVNQSKDPEG		LRVFYYLVQD		LKCLVFSLIG		LHFKIKPI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12