MARF1

MARF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DGX, 2DIU
Ідентифікатори
Символи	MARF1, LKAP, PPP1R34, KIAA0430, LMKB, meiosis regulator and mRNA stability factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614593 MGI: 2444505 HomoloGene: 40967 GeneCards: MARF1
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding • молекулярна функція Клітинна компонента • пероксисома • мембрана • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • регуляція експресії генів • диференціація клітин • GO:0007126 мейоз • female meiotic nuclear division • double-strand break repair • Оогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9665	223989
Ensembl	ENSG00000166783 ENSG00000277140	ENSMUSG00000060657
UniProt	Q9Y4F3	Q8BJ34
RefSeq (мРНК)	NM_001184998 NM_001184999 NM_014647 NM_019081	NM_001081154
RefSeq (білок)	NP_001171927 NP_001171928 NP_055462	NP_001074623
Локус (UCSC)	Хр. 16: 15.59 – 15.64 Mb	Хр. 16: 13.93 – 13.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MARF1 (англ. Meiosis regulator and mRNA stability factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 742 амінокислот, а молекулярна маса — 192 859.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMEGNGTENS		CSRTRGWLQQ		DNDAKPWLWK		FSNCFSRPEQ		TLPHSPQTKE
YMENKKVAVE		LKDVPSPLHA		GSKLFPAVPL		PDIRSLQQPK		IQLSSVPKVS
CCAHCPNEPS		TSPMRFGGGG		GGSGGTSSLI		HPGALLDSQS		TRTITCQVGS
GFAFQSASSL		QNASARNNLA		GIASDFPSMC		LESNLSSCKH		LPCCGKLHFQ
SCHGNVHKLH		QFPSLQGCTS		AGYFPCSDFT		SGAPGHLEEH		ISQSELTPHL
CTNSLHLNVV		PPVCLKGSLY		CEDCLNKPAR		NSIIDAAKVW		PNIPPPNTQP
APLAVPLCNG		CGTKGTGKET		TLLLATSLGK		AASKFGSPEV		AVAGQVLENL
PPIGVFWDIE		NCSVPSGRSA		TAVVQRIREK		FFKGHREAEF		ICVCDISKEN
KEVIQELNNC		QVTVAHINAT		AKNAADDKLR		QSLRRFANTH		TAPATVVLVS
TDVNFALELS		DLRHRHGFHI		ILVHKNQASE		ALLHHANELI		RFEEFISDLP
PRLPLKMPQC		HTLLYVYNLP		ANKDGKSVSN		RLRRLSDNCG		GKVLSITGCS
AILRFINQDS		AERAQKRMEN		EDVFGNRIIV		SFTPKNRELC		ETKSSNAIAD
KVKSPKKLKN		PKLCLIKDAS		EQSSSAKATP		GKGSQANSGS		ATKNTNVKSL
QELCRMESKT		GHRNSEHQQG		HLRLVVPTHG		NSSAAVSTPK		NSGVAEPVYK
TSQKKENLSA		RSVTSSPVEK		KDKEETVFQV		SYPSAFSKLV		ASRQVSPLLA
SQSWSSRSMS		PNLLNRASPL		AFNIANSSSE		ADCPDPFANG		ADVQVSNIDY
RLSRKELQQL		LQEAFARHGK		VKSVELSPHT		DYQLKAVVQM		ENLQDAIGAV
NSLHRYKIGS		KKILVSLATG		AASKSLSLLS		AETMSVLQDA		PACCLPLFKF
TDIYEKKFGH		KLNVSDLYKL		TDTVAIREQG		NGRLVCLLPS		SQARQSPLGS
SQSHDGSSTN		CSPIIFEELE		YHEPVCRQHC		SNKDFSEHEF		DPDSYKIPFV
ILSLKTFAPQ		VHSLLQTHEG		TVPLLSFPDC		YIAEFGDLEV		VQENQGGVPL
EHFITCVPGV		NIATAQNGIK		VVKWIHNKPP		PPNTDPWLLR		SKSPVGNPQL
IQFSREVIDL		LKSQPSCVIP		ISHFIPSYHH		HFAKQCRVSD		YGYSKLIELL
EAVPHVLQIL		GMGSKRLLTL		THRAQVKRFT		QDLLKLLKSQ		ASKQVIVREF
SQAYHWCFSK		DWDVTEYGVC		ELIDIVSEIP		DTTICLSQQD		NEMVICIPKR
ERTQDEIERT		KQFSKDVVDL		LRHQPHFRMP		FNKFIPSYHH		HFGRQCKLAY
YGFTKLLELF		EAIPDTLQVL		ECGEEKILTL		TEVERFKALA		AQFVKLLRSQ
KDNCLMMTDL		LTEYAKTFGY		TFRLQDYDVS		SISALTQKLC		HVVKVADIES
GRQIQLINRK		SLRSLTAQLL		VLLMSWEGTT		HLSVEELKRH		YESTHNTPLN
PCEYGFMTLT		ELLKSLPYLV		EVFTNDKMEE		CVKLTSLYLF		AKNVRSLLHT
YHYQQIFLHE		FSMAYTKYVG		ETLQPKTYGH		SSVEELLGAI		PQVVWIKGHG
HKRIVVLKND		MKSRLSSLSL		SPANHENQPS		EGERILEVPE		SHTASELKLG
ADGSGPSHTE		QELLRLTDDS		PVDLLCAPVP		SCLPSPQLRP		DPVILQSADL
IQFEERPQEP		SEIMILNQEE		KMEIPIPGKS		KTLTSDSSSS		CISAAVPVPP
CPSSETSESL		LSKDPVESPA		KKQPKNRVKL		AANFSLAPIT		KL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у пероксисомах.

Література

• Dunster K., Lai F.P.L., Sentry J.W. (2005). Limkain b1, a novel human autoantigen localized to a subset of ABCD3 and PXF marked peroxisomes. Clin. Exp. Immunol. 140: 556—563. PMID 15932519 DOI:10.1111/j.1365-2249.2005.02774.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122
• Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13

Див. також

• Хромосома 16