METTL16

METTL16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2H00
Ідентифікатори
Символи	METTL16, METT10D, methyltransferase like 16, methyltransferase 16, N6-methyladenosine
Зовнішні ІД	MGI: 1914743 HomoloGene: 34653 GeneCards: METTL16
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • 23S rRNA (adenine(1618)-N(6))-methyltransferase activity • mRNA (2'-O-methyladenosine-N6-)-methyltransferase activity • U6 snRNA 3'-end binding • RNA stem-loop binding • U6 snRNA (adenine-(43)-N(6))-methyltransferase activity • RNA binding • mRNA (N6-adenosine)-methyltransferase activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • rRNA base methylation • Метилювання • posttranscriptional regulation of gene expression • mRNA methylation • snRNA (adenine-N6)-methylation • mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • RNA methylation • mRNA catabolic process • S-adenosylmethionine biosynthetic process • mRNA destabilization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79066	67493
Ensembl	ENSG00000127804	ENSMUSG00000010554
UniProt	Q86W50	Q9CQG2
RefSeq (мРНК)	NM_024086	NM_026197
RefSeq (білок)	NP_076991	NP_080473
Локус (UCSC)	Хр. 17: 2.41 – 2.51 Mb	Хр. 11: 74.66 – 74.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

METTL16 (англ. Methyltransferase like 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 562 амінокислот, а молекулярна маса — 63 621.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALSKSMHAR		NRYKDKPPDF		AYLASKYPDF		KQHVQINLNG		RVSLNFKDPE
AVRALTCTLL		REDFGLSIDI		PLERLIPTVP		LRLNYIHWVE		DLIGHQDSDK
STLRRGIDIG		TGASCIYPLL		GATLNGWYFL		ATEVDDMCFN		YAKKNVEQNN
LSDLIKVVKV		PQKTLLMDAL		KEESEIIYDF		CMCNPPFFAN		QLEAKGVNSR
NPRRPPPSSV		NTGGITEIMA		EGGELEFVKR		IIHDSLQLKK		RLRWYSCMLG
KKCSLAPLKE		ELRIQGVPKV		TYTEFCQGRT		MRWALAWSFY		DDVTVPSPPS
KRRKLEKPRK		PITFVVLASV		MKELSLKASP		LRSETAEGIV		VVTTWIEKIL
TDLKVQHKRV		PCGKEEVSLF		LTAIENSWIH		LRRKKRERVR		QLREVPRAPE
DVIQALEEKK		PTPKESGNSQ		ELARGPQERT		PCGPALREGE		AAAVEGPCPS
QESLSQEENP		EPTEDERSEE		KGGVEVLESC		QGSSNGAQDQ		EASEQFGSPV
AERGKRLPGV		AGQYLFKCLI		NVKKEVDDAL		VEMHWVEGQN		RDLMNQLCTY
IRNQIFRLVA		VN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brown J.A., Kinzig C.G., DeGregorio S.J., Steitz J.A. (2016). Methyltransferase-like protein 16 binds the 3'-terminal triple helix of MALAT1 long noncoding RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 14013—14018. PMID 27872311 DOI:10.1073/pnas.1614759113

Див. також

• Хромосома 17