MEX3D

MEX3D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DGR
Ідентифікатори
Символи	MEX3D, MEX-3D, MEX3, OK/SW-cl.4, RKHD1, RNF193, TINO, mex-3 RNA binding family member D
Зовнішні ІД	OMIM: 611009 MGI: 2681847 HomoloGene: 16890 GeneCards: MEX3D
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA destabilization • mRNA localization resulting in posttranscriptional regulation of gene expression Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	399664	237400
Ensembl	ENSG00000181588	ENSMUSG00000048696
UniProt	Q86XN8	Q3UE17
RefSeq (мРНК)	NM_001174118 NM_203304	NM_198615
RefSeq (білок)	NP_001167589 NP_976049	NP_941017
Локус (UCSC)	Хр. 19: 1.55 – 1.57 Mb	Хр. 10: 80.22 – 80.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MEX3D (англ. Mex-3 RNA binding family member D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 651 амінокислот, а молекулярна маса — 64 883.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSSLGQPDG		GGGGGGGGGG		VGAAGEDPGP		GPAPPPEGAQ		EAAPAPRPPP
EPDDAAAALR		LALDQLSALG		LGGAGDTDEE		GAAGDGAAAA		GGADGGAAPE
PVPPDGPEAG		APPTLAPAVA		PGSLPLLDPN		ASPPPPPPPR		PSPPDVFAGF
APHPAALGPP		TLLADQMSVI		GSRKKSVNMT		ECVPVPSSEH		VAEIVGRQGC
KIKALRAKTN		TYIKTPVRGE		EPVFIVTGRK		EDVEMAKREI		LSAAEHFSII
RATRSKAGGL		PGAAQGPPNL		PGQTTIQVRV		PYRVVGLVVG		PKGATIKRIQ
QRTHTYIVTP		GRDKEPVFAV		TGMPENVDRA		REEIEAHITL		RTGAFTDAGP
DSDFHANGTD		VCLDLLGAAA		SLWAKTPNQG		RRPPTATAGL		RGDTALGAPS
APEAFYAGSR		GGPSVPDPGP		ASPYSGSGNG		GFAFGAEGPG		APVGTAAPDD
CDFGFDFDFL		ALDLTVPAAA		TIWAPFERAA		PLPAFSGCST		VNGAPGPPAA
GARRSSGAGT		PRHSPTLPEP		GGLRLELPLS		RRGAPDPVGA		LSWRPPQGPV
SFPGGAAFST		ATSLPSSPAA		AACAPLDSGA		SENSRKPPSA		SSAPALAREC
VVCAEGEVMA		ALVPCGHNLF		CMDCAVRICG		KSEPECPACR		TPATQAIHIF
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19