MGAT5B

MGAT5B
Ідентифікатори
Символи	MGAT5B, GnT-IX, GnT-VB, mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase, isozyme B, alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B
Зовнішні ІД	OMIM: 612441 MGI: 3606200 HomoloGene: 27821 GeneCards: MGAT5B
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • glycosyltransferase activity • alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity • manganese ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • Golgi membrane • мембрана • комплекс Ґольджі Біологічний процес • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein N-linked glycosylation • protein O-linked glycosylation via serine Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	146664	268510
Ensembl	ENSG00000167889	ENSMUSG00000043857
UniProt	Q3V5L5	Q765H6
RefSeq (мРНК)	NM_001199172 NM_144677 NM_198955	NM_172948
RefSeq (білок)	NP_001186101 NP_653278 NP_945193	NP_766536
Локус (UCSC)	Хр. 17: 76.87 – 76.95 Mb	Хр. 11: 116.81 – 116.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MGAT5B (англ. Mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase, isozyme B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 792 амінокислот, а молекулярна маса — 89 535.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MITVNPDGKI		MVRRCLVTLR		PFRLFVLGIG		FFTLCFLMTS		LGGQFSARRL
GDSPFTIRTE		VMGGPESRGV		LRKMSDLLEL		MVKRMDALAR		LENSSELHRA
GGDLHFPADR		MPPGAGLMER		IQAIAQNVSD		IAVKVDQILR		HSLLLHSKVS
EGRRDQCEAP		SDPKFPDCSG		KVEWMRARWT		SDPCYAFFGV		DGTECSFLIY
LSEVEWFCPP		LPWRNQTAAQ		RAPKPLPKVQ		AVFRSNLSHL		LDLMGSGKES
LIFMKKRTKR		LTAQWALAAQ		RLAQKLGATQ		RDQKQILVHI		GFLTEESGDV
FSPRVLKGGP		LGEMVQWADI		LTALYVLGHG		LRVTVSLKEL		QSNLGVPPGR
GSCPLTMPLP		FDLIYTDYHG		LQQMKRHMGL		SFKKYRCRIR		VIDTFGTEPA
YNHEEYATLH		GYRTNWGYWN		LNPKQFMTMF		PHTPDNSFMG		FVSEELNETE
KRLIKGGKAS		NMAVVYGKEA		SIWKLQGKEK		FLGILNKYME		IHGTVYYESQ
RPPEVPAFVK		NHGLLPQPEF		QQLLRKAKLF		IGFGFPYEGP		APLEAIANGC
IFLQSRFSPP		HSSLNHEFFR		GKPTSREVFS		QHPYAENFIG		KPHVWTVDYN
NSEEFEAAIK		AIMRTQVDPY		LPYEYTCEGM		LERIHAYIQH		QDFCRAPDPA
LPEAHAPQSP		FVLAPNATHL		EWARNTSLAP		GAWPPAHALR		AWLAVPGRAC
TDTCLDHGLI		CEPSFFPFLN		SQDAFLKLQV		PCDSTESEMN		HLYPAFAQPG
QECYLQKEPL		LFSCAGSNTK		YRRLCPCRDF		RKGQVALCQG		CL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Abbott K.L., Troupe K., Lee I., Pierce M. (2006). Integrin-dependent neuroblastoma cell adhesion and migration on laminin is regulated by expression levels of two enzymes in the O-mannosyl-linked glycosylation pathway, PomGnT1 and GnT-Vb. Exp. Cell Res. 312: 2837—2850. PMID 16857188 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.05.022

Див. також

• Хромосома 17