MICAL2

MICAL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E9K
Ідентифікатори
Символи	MICAL2, MICAL-2, MICAL2PV1, MICAL2PV2, microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608881 MGI: 2444947 HomoloGene: 8760 GeneCards: MICAL2
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • FAD binding • зв'язування з іоном металу • monooxygenase activity • oxidoreductase activity • NADPH:sulfur oxidoreductase activity • NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • heart looping • actin filament depolymerization • heart development • cytoskeleton organization • sulfur oxidation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9645	320878
Ensembl	ENSG00000133816	ENSMUSG00000038244
UniProt	O94851	Q8BML1
RefSeq (мРНК)	NM_001282663 NM_001282664 NM_001282665 NM_001282666 NM_001282667 NM_001282668 NM_001346292 NM_001346293 NM_001346294 NM_001346295 NM_001346296 NM_001346297 NM_001346298 NM_001346299 NM_014632	NM_001193305 NM_177282
RefSeq (білок)	NP_001269592 NP_001269593 NP_001269594 NP_001269595 NP_001269596 NP_001269597 NP_001333221 NP_001333222 NP_001333223 NP_001333224 NP_001333225 NP_001333226 NP_001333227 NP_001333228 NP_055447	NP_001180234 NP_796256
Локус (UCSC)	Хр. 11: 12.09 – 12.36 Mb	Хр. 7: 112.23 – 112.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MICAL2 (англ. Microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 126 689.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGENEDEKQA		QAGQVFENFV		QASTCKGTLQ		AFNILTRHLD		LDPLDHRNFY
SKLKSKVTTW		KAKALWYKLD		KRGSHKEYKR		GKSCTNTKCL		IVGGGPCGLR
TAIELAYLGA		KVVVVEKRDS		FSRNNVLHLW		PFTIHDLRGL		GAKKFYGKFC
AGSIDHISIR		QLQLILFKVA		LMLGVEIHVN		VEFVKVLEPP		EDQENQKIGW
RAEFLPTDHS		LSEFEFDVII		GADGRRNTLE		GFRRKEFRGK		LAIAITANFI
NRNSTAEAKV		EEISGVAFIF		NQKFFQDLKE		ETGIDLENIV		YYKDCTHYFV
MTAKKQSLLD		KGVIINDYID		TEMLLCAENV		NQDNLLSYAR		EAADFATNYQ
LPSLDFAMNH		YGQPDVAMFD		FTCMYASENA		ALVRERQAHQ		LLVALVGDSL
LEPFWPMGTG		CARGFLAAFD		TAWMVKSWNQ		GTPPLELLAE		RESLYRLLPQ
TTPENINKNF		EQYTLDPGTR		YPNLNSHCVR		PHQVKHLYIT		KELEHYPLER
LGSVRRSVNL		SRKESDIRPS		KLLTWCQQQT		EGYQHVNVTD		LTTSWRSGLA
LCAIIHRFRP		ELINFDSLNE		DDAVENNQLA		FDVAEREFGI		PPVTTGKEMA
SAQEPDKLSM		VMYLSKFYEL		FRGTPLRPVD		SWRKNYGENA		DLSLAKSSIS
NNYLNLTFPR		KRTPRVDGQT		GENDMNKRRR		KGFTNLDEPS		NFSSRSLGSN
QECGSSKEGG		NQNKVKSMAN		QLLAKFEEST		RNPSLMKQER		RVSGIGKPVL
CSSSGPPVHS		CCPKPEEATP		SPSPPLKRQF		PSVVVTGHVL		RELKQVSAGS
ECLSRPWRAR		AKSDLQLGGT		ENFATLPSTR		PRAQALSGVL		WRLQQVEEKI
LQKRAQNLAN		REFHTKNIKE		KAAHLASMFG		HGDFPQNKLL		SKGLSHTHPP
SPPSRLPSPD		PAASSSPSTV		DSASPARKEK		KSPSGFHFHP		SHLRTVHPQL
TVGKVSSGIG		AAAEVLVNLY		MNDHRPKAQA		TSPDLESMRK		SFPLNLGGSD
TCYFCKKRVY		VMERLSAEGH		FFHRECFRCS		ICATTLRLAA		YTFDCDEGKF
YCKPHFIHCK		TNSKQRKRRA		ELKQQREEEA		TWQEQEAPRR		DTPTESSCAV
AAIGTLEGSP		PVHFSLPVLH		PLLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, НАДФ, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Terman J.R., Mao T., Pasterkamp R.J., Yu H.-H., Kolodkin A.L. (2002). MICALs, a family of conserved flavoprotein oxidoreductases, function in plexin-mediated axonal repulsion. Cell. 109: 887—900. PMID 12110185 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00794-8
• Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
• McDonald C.A., Liu Y.Y., Palfey B.A. (2013). Actin stimulates reduction of the MICAL-2 monooxygenase domain. Biochemistry. 52: 6076—6084. PMID 23927065 DOI:10.1021/bi4008462

Див. також

• Хромосома 11