MICAL3

MICAL3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D88
Ідентифікатори
Символи	MICAL3, MICAL-3, microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 608882 MGI: 2442733 HomoloGene: 85288 GeneCards: MICAL3
Онтологія гена Молекулярна функція • monooxygenase activity • oxidoreductase activity • actin binding • FAD binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen Клітинна компонента • клітинна мембрана • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • веретено поділу • cell cortex • midbody • cell projection Біологічний процес • actin filament depolymerization • cytoskeleton organization • екзоцитоз • клітинний цикл • поділ клітини Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57553	194401
Ensembl	ENSG00000243156	ENSMUSG00000051586
UniProt	Q7RTP6	Q8CJ19
RefSeq (мРНК)	NM_001122731 NM_001136004 NM_015241 NM_020793	NM_001270475 NM_153396
RefSeq (білок)	NP_001116203 NP_001129476 NP_056056	NP_001257404 NP_700445
Локус (UCSC)	Хр. 22: 17.79 – 18.02 Mb	Хр. 6: 120.93 – 121.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MICAL3 (англ. Microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 002 амінокислот, а молекулярна маса — 224 295.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEERKHETMN		PAHVLFDRFV		QATTCKGTLK		AFQELCDHLE		LKPKDYRSFY
HKLKSKLNYW		KAKALWAKLD		KRGSHKDYKK		GKACTNTKCL		IIGAGPCGLR
TAIDLSLLGA		KVVVIEKRDA		FSRNNVLHLW		PFTIHDLRGL		GAKKFYGKFC
AGAIDHISIR		QLQLILLKVA		LILGIEIHVN		VEFQGLIQPP		EDQENERIGW
RALVHPKTHP		VSEYEFEVII		GGDGRRNTLE		GFRRKEFRGK		LAIAITANFI
NRNTTAEAKV		EEISGVAFIF		NQKFFQELRE		ATGIDLENIV		YYKDDTHYFV
MTAKKQSLLD		KGVILHDYAD		TELLLSRENV		DQEALLSYAR		EAADFSTQQQ
LPSLDFAINH		YGQPDVAMFD		FTCMYASENA		ALVREQNGHQ		LLVALVGDSL
LEPFWPMGTG		IARGFLAAMD		SAWMVRSWSL		GTSPLEVLAE		RESIYRLLPQ
TTPENVSKNF		SQYSIDPVTR		YPNINVNFLR		PSQVRHLYDT		GETKDIHLEM
ESLVNSRTTP		KLTRNESVAR		SSKLLGWCQR		QTDGYAGVNV		TDLTMSWKSG
LALCAIIHRY		RPDLIDFDSL		DEQNVEKNNQ		LAFDIAEKEL		GISPIMTGKE
MASVGEPDKL		SMVMYLTQFY		EMFKDSLPSS		DTLDLNAEEK		AVLIASTRSP
ISFLSKLGQT		ISRKRSPKDK		KEKDLDGAGK		RRKTSQSEEE		EAPRGHRGER
PTLVSTLTDR		RMDVAVGNQN		KVKYMATQLL		AKFEENAPAQ		SIGIRRQGSM
KKEFPQNLGG		SDTCYFCQKR		VYVMERLSAE		GKFFHRSCFK		CEYCATTLRL
SAYAYDIEDG		KFYCKPHYCY		RLSGYAQRKR		PAVAPLSGKE		AKGPLQDGAT
TDANGRANAV		ASSTERTPGS		GVNGLEEPSI		AKRLRGTPER		IELENYRLSL
RQAEALQEVP		EETQAEHNLS		SVLDTGAEED		VASSSSESEM		EEEGEEEEEE
PRLPPSDLGG		VPWKEAVRIH		ALLKGKSEEE		LEASKSFGPG		NEEEEEEEEE
YEEEEEEDYD		EEEEESSEAG		NQRLQQVMHA		ADPLEIQADV		HWTHIREREE
EERMAPASES		SASGAPLDEN		DLEEDVDSEP		AEIEGEAAED		GDPGDTGAEL
DDDQHWSDSP		SDADRELRLP		CPAEGEAELE		LRVSEDEEKL		PASPKHQERG
PSQATSPIRS		PQESALLFIP		VHSPSTEGPQ		LPPVPAATQE		KSPEERLFPE
PLLPKEKPKA		DAPSDLKAVH		SPIRSQPVTL		PEARTPVSPG		SPQPQPPVAA
STPPPSPLPI		CSQPQPSTEA		TVPSPTQSPI		RFQPAPAKTS		TPLAPLPVQS
QSDTKDRLGS		PLAVDEALRR		SDLVEEFWMK		SAEIRRSLGL		TPVDRSKGPE
PSFPTPAFRP		VSLKSYSVEK		SPQDEGLHLL		KPLSIPKRLG		LPKPEGEPLS
LPTPRSPSDR		ELRSAQEERR		ELSSSSGLGL		HGSSSNMKTL		GSQSFNTSDS
AMLTPPSSPP		PPPPPGEEPA		TLRRKLREAE		PNASVVPPPL		PATWMRPPRE
PAQPPREEVR		KSFVESVEEI		PFADDVEDTY		DDKTEDSSLQ		EKFFTPPSCW
PRPEKPRHPP		LAKENGRLPA		LEGTLQPQKR		GLPLVSAEAK		ELAEERMRAR
EKSVKSQALR		DAMARQLSRM		QQMELASGAP		RPRKASSAPS		QGKERRPDSP
TRPTLRGSEE		PTLKHEATSE		EVLSPPSDSG		GPDGSFTSSE		GSSGKSKKRS
SLFSPRRNKK		EKKSKGEGRP		PEKPSSNLLE		EAAAKPKSLW		KSVFSGYKKD
KKKKADDKSC		PSTPSSGATV		DSGKHRVLPV		VRAELQLRRQ		LSFSEDSDLS
SDDVLEKSSQ		KSRREPRTYT		EEELNAKLTR		RVQKAARRQA		KQEELKRLHR
AQIIQRQLQQ		VEERQRRLEE		RGVAVEKALR		GEAGMGKKDD		PKLMQEWFKL
VQEKNAMVRY		ESELMIFARE		LELEDRQSRL		QQELRERMAV		EDHLKTEEEL
SEEKQILNEM		LEVVEQRDSL		VALLEEQRLR		EREEDKDLEA		AMLSKGFSLN
WS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, НАДФ, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Terman J.R., Mao T., Pasterkamp R.J., Yu H.-H., Kolodkin A.L. (2002). MICALs, a family of conserved flavoprotein oxidoreductases, function in plexin-mediated axonal repulsion. Cell. 109: 887—900. PMID 12110185 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00794-8
• Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182

Див. також

• Хромосома 22