MSH5

MSH5
Ідентифікатори
Символи	MSH5, G7, MUTSH5, NG23, mutS homolog 5, POF13
Зовнішні ІД	OMIM: 603382 MGI: 1329021 HomoloGene: 8415 GeneCards: MSH5
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • damaged DNA binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • mismatched DNA binding • guanine/thymine mispair binding • single thymine insertion binding Клітинна компонента • synaptonemal complex • mismatch repair complex Біологічний процес • GO:0007126 мейоз • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • DNA mismatch repair • chiasma assembly • resolution of meiotic recombination intermediates • reciprocal meiotic recombination • homologous chromosome segregation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4439	17687
Ensembl	ENSG00000230961 ENSG00000235569 ENSG00000204410 ENSG00000230293 ENSG00000235222 ENSG00000237333 ENSG00000227314 ENSG00000233345	ENSMUSG00000007035
UniProt	O43196 Q5SSR2	Q9QUM7
RefSeq (мРНК)	NM_172166 NM_002441 NM_025259 NM_172165	NM_001146215 NM_013600
RefSeq (білок)	NP_002432 NP_079535 NP_751897 NP_751898 NP_751897.1	NP_001139687 NP_038628
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.74 – 31.76 Mb	Хр. 17: 35.03 – 35.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MSH5 (англ. MutS homolog 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 834 амінокислот, а молекулярна маса — 92 875.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASLGANPRR		TPQGPRPGAA		SSGFPSPAPV		PGPREAEEEE		VEEEEELAEI
HLCVLWNSGY		LGIAYYDTSD		STIHFMPDAP		DHESLKLLQR		VLDEINPQSV
VTSAKQDENM		TRFLGKLASQ		EHREPKRPEI		IFLPSVDFGL		EISKQRLLSG
NYSFIPDAMT		ATEKILFLSS		IIPFDCLLTV		RALGGLLKFL		GRRRIGVELE
DYNVSVPILG		FKKFMLTHLV		NIDQDTYSVL		QIFKSESHPS		VYKVASGLKE
GLSLFGILNR		CHCKWGEKLL		RLWFTRPTHD		LGELSSRLDV		IQFFLLPQNL
DMAQMLHRLL		GHIKNVPLIL		KRMKLSHTKV		SDWQVLYKTV		YSALGLRDAC
RSLPQSIQLF		RDIAQEFSDD		LHHIASLIGK		VVDFEGSLAE		NRFTVLPNID
PEIDEKKRRL		MGLPSFLTEV		ARKELENLDS		RIPSCSVIYI		PLIGFLLSIP
RLPSMVEASD		FEINGLDFMF		LSEEKLHYRS		ARTKELDALL		GDLHCEIRDQ
ETLLMYQLQC		QVLARAAVLT		RVLDLASRLD		VLLALASAAR		DYGYSRPRYS
PQVLGVRIQN		GRHPLMELCA		RTFVPNSTEC		GGDKGRVKVI		TGPNSSGKSI
YLKQVGLITF		MALVGSFVPA		EEAEIGAVDA		IFTRIHSCES		ISLGLSTFMI
DLNQVAKAVN		NATAQSLVLI		DEFGKGTNTV		DGLALLAAVL		RHWLARGPTC
PHIFVATNFL		SLVQLQLLPQ		GPLVQYLTME		TCEDGNDLVF		FYQVCEGVAK
ASHASHTAAQ		AGLPDKLVAR		GKEVSDLIRS		GKPIKPVKDL		LKKNQMENCQ
TLVDKFMKLD		LEDPNLDLNV		FMSQEVLPAA		TSIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК.

Література

• Her C., Doggett N.A. (1998). Cloning, structural characterization, and chromosomal localization of the human orthologue of Saccharomyces cerevisiae MSH5 gene. Genomics. 52: 50—61. PMID 9740671 DOI:10.1006/geno.1998.5374
• Winand N.J., Panzer J.A., Kolodner R.D. (1998). Cloning and characterization of the human and Caenorhabditis elegans homologs of the Saccharomyces cerevisiae MSH5 gene. Genomics. 53: 69—80. PMID 9787078 DOI:10.1006/geno.1998.5447
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6