MYRIP

MYRIP
Ідентифікатори
Символи	MYRIP, SLAC2-C, SLAC2C, myosin VIIA and Rab interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 611790 MGI: 2384407 HomoloGene: 9150 GeneCards: MYRIP
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase A binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • myosin binding Клітинна компонента • цитоплазма • Меланосома • perinuclear region of cytoplasm • photoreceptor outer segment • exocyst • синапс • dense core granule • transport vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • actin cytoskeleton • cortical actin cytoskeleton Біологічний процес • intracellular protein transport • positive regulation of insulin secretion • vesicle transport along actin filament Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25924	245049
Ensembl	ENSG00000170011	ENSMUSG00000041794
UniProt	Q8NFW9	Q8K3I4
RefSeq (мРНК)	NM_001284423 NM_001284424 NM_001284425 NM_001284426 NM_015460	NM_144557
RefSeq (білок)	NP_001271352 NP_001271353 NP_001271354 NP_001271355 NP_056275	NP_653140
Локус (UCSC)	Хр. 3: 39.81 – 40.26 Mb	Хр. 9: 120.13 – 120.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYRIP (англ. Myosin VIIA and Rab interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 859 амінокислот, а молекулярна маса — 95 706.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRKLDLSGL		TDDETEHVLQ		VVQRDFNLRK		KEEERLSELK		QKLDEEGSKC
SILSKHQQFV		EHCCMRCCSP		FTFLVNTKRQ		CGDCKFNVCK		SCCSYQKHEK
AWVCCVCQQA		RLLRAQSLEW		FYNNVKSRFK		RFGSAKVLKN		LYRKHRLESG
ACFDILGGSL		FESNLENEGS		ISGSDSTFYR		QSEGHSVMDT		LAVALRVAEE
AIEEAISKAE		AYGDSLDKQN		EASYLRDHKE		ELTEELATTI		LQKIIRKQKS
KSEQQVEEEP		GWPHPQSCST		KVADEGTSAS		PGGYRAPAAL		WRSQSAFSIT
GEEALKTPPV		EAPSRQPRDQ		GQHPRAESAL		PSWKSVDRLD		ETNLAPVLQS
PDGNWVALKD		GAPPPTRLLA		KPKSGTFQAL		EVASSVASAY		DEMGSDSEED
FDWSEALSKL		CPRSRALPRN		PQPQPTQAQS		SDQGPIAASP		SSALSPNPEA
MCSDSETSSA		GSSREVGHQA		RLSWLQRKAP		RNPAAEKMRL		HGELDVNFNP
QLASRETSDS		SEPEEAPHTT		DRRARRWRRA		RLGSEEPSKE		PSSPSAQLRD
LDTHQVSDDL		SETDISNEAR		DPQTLTDTTE		EKRRNRLYEL		AMKMSEKETS
SGEDQESEPK		TESENQKESL		SSEDNSQSVQ		EELKKKFSAV		SLCNISTEVL
KVINATEELI		AGSTGPWESP		QVPPDRQKGM		FPRGTDQVRL		DEQLTSLEEN
VYLAAGTVYG		LETQLTELED		AARCIHSGTD		ETHLADLEDQ		VATAAAQVHH
AELQISDIES		RISALTIAGL		NIAPCVRFTR		RRDQKQRTQV		QTIDTSRQQR
RKLPAPPVKA		EKIETSSVTT		IKTFNHNFIL		QGSSTNRTKE		RKGTTKDLME
PALESAVMY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Fukuda M., Kuroda T.S. (2002). Slac2-c (synaptotagmin-like protein homologue lacking C2 domains-c), a novel linker protein that interacts with Rab27, myosin Va/VIIa, and actin. J. Biol. Chem. 277: 43096—43103. PMID 12221080 DOI:10.1074/jbc.M203862200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Goehring A.S., Pedroja B.S., Hinke S.A., Langeberg L.K., Scott J.D. (2007). MyRIP anchors protein kinase A to the exocyst complex. J. Biol. Chem. 282: 33155—33167. PMID 17827149 DOI:10.1074/jbc.M705167200

Див. також

• Хромосома 3