NCBP2

NCBP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H2T, 1H2U, 1H2V, 1H6K, 1N52, 1N54, 3FEX, 3FEY
Ідентифікатори
Символи	NCBP2, CBC2, CBP20, NIP1, PIG55, nuclear cap binding protein subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605133 MGI: 1915342 HomoloGene: 56377 GeneCards: NCBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding • RNA cap binding • RNA 7-methylguanosine cap binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Нуклеоплазма • mRNA cap binding complex • nuclear cap binding complex • клітинне ядро • RNA cap binding complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA transport • positive regulation of mRNA 3'-end processing • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • mRNA processing • snRNA export from nucleus • transcription by RNA polymerase II • mRNA export from nucleus • positive regulation of RNA export from nucleus • regulation of mRNA polyadenylation • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • mRNA cis splicing, via spliceosome • Сайленсинг генів • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • mRNA 3'-end processing • histone mRNA metabolic process • regulation of translation • regulation of translational initiation • snRNA transcription by RNA polymerase II • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • nuclear export • 7-methylguanosine mRNA capping • RNA metabolic process • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22916	68092
Ensembl	ENSG00000114503	ENSMUSG00000022774
UniProt	P52298	Q9CQ49
RefSeq (мРНК)	NM_001042540 NM_001308036 NM_007362	NM_026554
RefSeq (білок)	NP_001036005 NP_001294965 NP_031388	NP_080830
Локус (UCSC)	Хр. 3: 196.94 – 196.94 Mb	Хр. 16: 31.77 – 31.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCBP2 (англ. Nuclear cap binding protein subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 18 001.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGGLLKALR		SDSYVELSQY		RDQHFRGDNE		EQEKLLKKSC		TLYVGNLSFY
TTEEQIYELF		SKSGDIKKII		MGLDKMKKTA		CGFCFVEYYS		RADAENAMRY
INGTRLDDRI		IRTDWDAGFK		EGRQYGRGRS		GGQVRDEYRQ		DYDAGRGGYG
KLAQNQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Kataoka N., Ohno M., Moda I., Shimura Y. (1995). Identification of the factors that interact with NCBP, an 80 kDa nuclear cap binding protein. Nucleic Acids Res. 23: 3638—3641. PMID 7478990 DOI:10.1093/nar/23.18.3638
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Visa N., Izaurralde E., Ferreira J., Daneholt B., Mattaj I.W. (1996). A nuclear cap-binding complex binds Balbiani ring pre-mRNA cotranscriptionally and accompanies the ribonucleoprotein particle during nuclear export. J. Cell Biol. 133: 5—14. PMID 8601613 DOI:10.1083/jcb.133.1.5
• Gamberi C., Izaurralde E., Beisel C., Mattaj I.W. (1997). Interaction between the human nuclear cap-binding protein complex and hnRNP F. Mol. Cell. Biol. 17: 2587—2597. PMID 9111328 DOI:10.1128/MCB.17.5.2587
• Ishigaki Y., Li X., Serin G., Maquat L.E. (2001). Evidence for a pioneer round of mRNA translation: mRNAs subject to nonsense-mediated decay in mammalian cells are bound by CBP80 and CBP20. Cell. 106: 607—617. PMID 11551508 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00475-5
• Lejeune F., Ranganathan A.C., Maquat L.E. (2004). eIF4G is required for the pioneer round of translation in mammalian cells. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 992—1000. PMID 15361857 DOI:10.1038/nsmb824

Див. також

• Хромосома 3