NCKAP1

NCKAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3P8C, 4N78
Ідентифікатори
Символи	NCKAP1, HEM2, NAP1, NAP125, p125Nap1, NCK associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604891 MGI: 1355333 HomoloGene: 8384 GeneCards: NCKAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • гіалоплазма • cell projection • мембрана • SCAR complex • focal adhesion • клітинна мембрана • екзосома • lamellipodium membrane • ruffle • lamellipodium • filamentous actin Біологічний процес • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • central nervous system development • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • Rac protein signal transduction • GO:0022415 viral process • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of lamellipodium assembly • positive regulation of actin filament polymerization • GO:0000767 cell morphogenesis • cell migration • cell projection assembly • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization • neuron projection morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10787	50884
Ensembl	ENSG00000061676	ENSMUSG00000027002
UniProt	Q9Y2A7	P28660
RefSeq (мРНК)	NM_013436 NM_205842	NM_001290745 NM_016965 NM_001355410 NM_001355411
RefSeq (білок)	NP_038464 NP_995314	NP_001277674 NP_058661 NP_001342339 NP_001342340
Локус (UCSC)	Хр. 2: 182.91 – 183.04 Mb	Хр. 2: 80.33 – 80.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCKAP1 (англ. NCK associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 128 амінокислот, а молекулярна маса — 128 790.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRSVLQPSQ		QKLAEKLTIL		NDRGVGMLTR		LYNIKKACGD		PKAKPSYLID
KNLESAVKFI		VRKFPAVETR		NNNQQLAQLQ		KEKSEILKNL		ALYYFTFVDV
MEFKDHVCEL		LNTIDVCQVF		FDITVNFDLT		KNYLDLIITY		TTLMILLSRI
EERKAIIGLY		NYAHEMTHGA		SDREYPRLGQ		MIVDYENPLK		KMMEEFVPHS
KSLSDALISL		QMVYPRRNLS		ADQWRNAQLL		SLISAPSTML		NPAQSDTMPC
EYLSLDAMEK		WIIFGFILCH		GILNTDATAL		NLWKLALQSS		SCLSLFRDEV
FHIHKAAEDL		FVNIRGYNKR		INDIRECKEA		AVSHAGSMHR		ERRKFLRSAL
KELATVLSDQ		PGLLGPKALF		VFMALSFARD		EIIWLLRHAD		NMPKKSADDF
IDKHIAELIF		YMEELRAHVR		KYGPVMQRYY		VQYLSGFDAV		VLNELVQNLS
VCPEDESIIM		SSFVNTMTSL		SVKQVEDGEV		FDFRGMRLDW		FRLQAYTSVS
KASLGLADHR		ELGKMMNTII		FHTKMVDSLV		EMLVETSDLS		IFCFYSRAFE
KMFQQCLELP		SQSRYSIAFP		LLCTHFMSCT		HELCPEERHH		IGDRSLSLCN
MFLDEMAKQA		RNLITDICTE		QCTLSDQLLP		KHCAKTISQA		VNKKSKKQTG
KKGEPEREKP		GVESMRKNRL		VVTNLDKLHT		ALSELCFSIN		YVPNMVVWEH
TFTPREYLTS		HLEIRFTKSI		VGMTMYNQAT		QEIAKPSELL		TSVRAYMTVL
QSIENYVQID		ITRVFNNVLL		QQTQHLDSHG		EPTITSLYTN		WYLETLLRQV
SNGHIAYFPA		MKAFVNLPTE		NELTFNAEEY		SDISEMRSLS		ELLGPYGMKF
LSESLMWHIS		SQVAELKKLV		VENVDVLTQM		RTSFDKPDQM		AALFKRLSSV
DSVLKRMTII		GVILSFRSLA		QEALRDVLSY		HIPFLVSSIE		DFKDHIPRET
DMKVAMNVYE		LSSAAGLPCE		IDPALVVALS		SQKSENISPE		EEYKIACLLM
VFVAVSLPTL		ASNVMSQYSP		AIEGHCNNIH		CLAKAINQIA		AALFTIHKGS
IEDRLKEFLA		LASSSLLKIG		QETDKTTTRN		RESVYLLLDM		IVQESPFLTM
DLLESCFPYV		LLRNAYHAVY		KQSVTSSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2