NCSTN

NCSTN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4UPC, 5A63, 4UIS, 5FN3, 5FN4, 5FN5, 5FN2, 2N7R, 2N7Q
Ідентифікатори
Символи	NCSTN, ATAG1874, nicastrin
Зовнішні ІД	OMIM: 605254 MGI: 1891700 HomoloGene: 41029 GeneCards: NCSTN
Реагує на сполуку
	avagacestat, begacestat, nirogacestat
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • мембрана; • focal adhesion; • Меланосома; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • екзосома; • integral component of membrane; • azurophil granule membrane; • gamma-secretase complex; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • цитоплазма; • мітохондрія; • лізосома; • early endosome; • Синаптичні бульбашки; • endosome membrane; • GO:0009327 protein-containing complex; • Сарколема; • синапс; • synaptic membrane; • integral component of presynaptic membrane;
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch; • ephrin receptor signaling pathway; • myeloid cell homeostasis; • protein processing; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • amyloid-beta metabolic process; • epithelial cell proliferation; • протеоліз; • T cell proliferation; • membrane protein ectodomain proteolysis; • membrane protein intracellular domain proteolysis; • positive regulation of apoptotic process; • Notch receptor processing; • amyloid precursor protein catabolic process; • amyloid-beta formation; • amyloid precursor protein metabolic process; • neutrophil degranulation; • cerebellum development; • Notch receptor processing, ligand-dependent; • dopamine receptor signaling pathway; • glutamate receptor signaling pathway; • learning or memory; • central nervous system myelination; • adult behavior; • amyloid precursor protein biosynthetic process; • positive regulation of amyloid precursor protein biosynthetic process; • neuron apoptotic process; • neuron death; • cellular response to calcium ion; • regulation of long-term synaptic potentiation; • short-term synaptic potentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23385
	59287
	ENSG00000162736
	ENSMUSG00000003458
	Q92542
	P57716
	NM_001290184; NM_001290186; NM_015331; NM_001349729
	NM_021607
	NP_001277113; NP_001277115; NP_056146; NP_001336658
	NP_067620
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCSTN (англ. Nicastrin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 78 411^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATAGGGSGA	DPGSRGLLRL	LSFCVLLAGL	CRGNSVERKI	YIPLNKTAPC
VRLLNATHQI	GCQSSISGDT	GVIHVVEKEE	DLQWVLTDGP	NPPYMVLLES
KHFTRDLMEK	LKGRTSRIAG	LAVSLTKPSP	ASGFSPSVQC	PNDGFGVYSN
SYGPEFAHCR	EIQWNSLGNG	LAYEDFSFPI	FLLEDENETK	VIKQCYQDHN
LSQNGSAPTF	PLCAMQLFSH	MHAVISTATC	MRRSSIQSTF	SINPEIVCDP
LSDYNVWSML	KPINTTGTLK	PDDRVVVAAT	RLDSRSFFWN	VAPGAESAVA
SFVTQLAAAE	ALQKAPDVTT	LPRNVMFVFF	QGETFDYIGS	SRMVYDMEKG
KFPVQLENVD	SFVELGQVAL	RTSLELWMHT	DPVSQKNESV	RNQVEDLLAT
LEKSGAGVPA	VILRRPNQSQ	PLPPSSLQRF	LRARNISGVV	LADHSGAFHN
KYYQSIYDTA	ENINVSYPEW	LSPEEDLNFV	TDTAKALADV	ATVLGRALYE
LAGGTNFSDT	VQADPQTVTR	LLYGFLIKAN	NSWFQSILRQ	DLRSYLGDGP
LQHYIAVSSP	TNTTYVVQYA	LANLTGTVVN	LTREQCQDPS	KVPSENKDLY
EYSWVQGPLH	SNETDRLPRC	VRSTARLARA	LSPAFELSQW	SSTEYSTWTE
SRWKDIRARI	FLIASKELEL	ITLTVGFGIL	IFSLIVTYCI	NAKADVLFIA
PREPGAVSY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Satoh J., Kuroda Y. (2001). Nicastrin, a key regulator of presenilin function, is expressed constitutively in human neural cell lines. Neuropathology. 21: 115—122. PMID 11396676 DOI:10.1046/j.1440-1789.2001.00378.x
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Bai X.C., Rajendra E., Yang G., Shi Y., Scheres S.H. (2015). Sampling the conformational space of the catalytic subunit of human gamma-secretase. Elife. 4: —. PMID 26623517 DOI:10.7554/eLife.11182
Li Y., Liew L.S., Li Q., Kang C. (2016). Structure of the transmembrane domain of human nicastrin-a component of gamma-secretase. Sci. Rep. 6: 19522—19522. PMID 26776682 DOI:10.1038/srep19522