NDC1

NDC1
Ідентифікатори
Символи	NDC1, NET3, TMEM48, NDC1 transmembrane nucleoporin
Зовнішні ІД	OMIM: 610115 MGI: 1920037 HomoloGene: 41224 GeneCards: NDC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинна мембрана • ядерна пора • actin cytoskeleton • клітинне ядро • spindle pole body • nuclear pore transmembrane ring • host cell Біологічний процес • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • homologous chromosome pairing at meiosis • Сперматогенез • protein transport • regulation of cellular response to heat • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • GO:0046795 intracellular transport of virus • tRNA export from nucleus • spindle pole body duplication • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nuclear pore organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55706	72787
Ensembl	ENSG00000058804	ENSMUSG00000028614
UniProt	Q9BTX1	Q8VCB1
RefSeq (мРНК)	NM_001168551 NM_018087	NM_028355
RefSeq (білок)	NP_001162023 NP_060557	NP_082631
Локус (UCSC)	Хр. 1: 53.77 – 53.84 Mb	Хр. 4: 107.22 – 107.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NDC1 (англ. NDC1 transmembrane nucleoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 674 амінокислот, а молекулярна маса — 76 305.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATAVSRPCA		GRSRDILWRV		LGWRIVASIV		WSVLFLPICT		TVFIIFSRID
LFHPIQWLSD		SFSDLYSSYV		IFYFLLLSVV		IIIISIFNVE		FYAVVPSIPC
SRLALIGKII		HPQQLMHSFI		HAAMGMVMAW		CAAVITQGQY		SFLVVPCTGT
NSFGSPAAQT		CLNEYHLFFL		LTGAFMGYSY		SLLYFVNNMN		YLPFPIIQQY
KFLRFRRSLL		LLVKHSCVES		LFLVRNFCIL		YYFLGYIPKA		WISTAMNLHI
DEQVHRPLDT		VSGLLNLSLL		YHVWLCGVFL		LTTWYVSWIL		FKIYATEAHV
FPVQPPFAEG		SDECLPKVLN		SNPPPIIKYL		ALQDLMLLSQ		YSPSRRQEVF
SLSQPGGHPH		NWTAISRECL		NLLNGMTQKL		ILYQEAAATN		GRVSSSYPVE
PKKLNSPEET		AFQTPKSSQM		PRPSVPPLVK		TSLFSSKLST		PDVVSPFGTP
FGSSVMNRMA		GIFDVNTCYG		SPQSPQLIRR		GPRLWTSASD		QQMTEFSNPS
PSTSISAEGK		TMRQPSVIYS		WIQNKREQIK		NFLSKRVLIM		YFFSKHPEAS
IQAVFSDAQM		HIWALEGLSH		LVAASFTEDR		FGVVQTTLPA		ILNTLLTLQE
AVDKYFKLPH		ASSKPPRISG		SLVDTSYKTL		RFAFRASLKT		AIYRITTTFG
EHLNAVQASA		EHQKRLQQFL		EFKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schirmer E.C., Florens L., Guan T., Yates J.R. III, Gerace L. (2003). Nuclear membrane proteins with potential disease links found by subtractive proteomics. Science. 301: 1380—1382. PMID 12958361 DOI:10.1126/science.1088176
• Kind B., Koehler K., Lorenz M., Huebner A. (2009). The nuclear pore complex protein ALADIN is anchored via NDC1 but not via POM121 and GP210 in the nuclear envelope. Biochem. Biophys. Res. Commun. 390: 205—210. PMID 19782045 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.09.080

Див. також

• Хромосома 1