NET1

NET1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EO2, 4XH9
Ідентифікатори
Символи	NET1, ARHGEF8, NET1A, neuroepithelial cell transforming 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606450 MGI: 1927138 HomoloGene: 4283 GeneCards: NET1
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • клітинне ядро • внутрішньоклітинний Біологічний процес • cellular response to ionizing radiation • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • myoblast migration • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • regulation of Rho protein signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • regulation of cell growth • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of apoptotic process • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10276	56349
Ensembl	ENSG00000173848	ENSMUSG00000021215
UniProt	Q7Z628 Q5SQI7	Q9Z206
RefSeq (мРНК)	NM_001047160 NM_005863	NM_001047159 NM_019671
RefSeq (білок)	NP_001040625 NP_005854 NP_005854.2	NP_001040624 NP_062645
Локус (UCSC)	Хр. 10: 5.41 – 5.46 Mb	Хр. 13: 3.93 – 3.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NET1 (англ. Neuroepithelial cell transforming 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 596 амінокислот, а молекулярна маса — 67 740.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPELAAQKQ		PRPRRRSRRA		SGLSTEGATG		PSADTSGSEL		DGRCSLRRGS
SFTFLTPGPN		WDFTLKRKRR		EKDDDVVSLS		SLDLKEPSNK		RVRPLARVTS
LANLISPVRN		GAVRRFGQTI		QSFTLRGDHR		SPASAQKFSS		RSTVPTPAKR
RSSALWSEML		DITMKESLTT		REIRRQEAIY		EMSRGEQDLI		EDLKLARKAY
HDPMLKLSIM		SEEELTHIFG		DLDSYIPLHE		DLLTRIGEAT		KPDGTVEQIG
HILVSWLPRL		NAYRGYCSNQ		LAAKALLDQK		KQDPRVQDFL		QRCLESPFSR
KLDLWSFLDI		PRSRLVKYPL		LLKEILKHTP		KEHPDVQLLE		DAILIIQGVL
SDINLKKGES		ECQYYIDKLE		YLDEKQRDPR		IEASKVLLCH		GELRSKSGHK
LYIFLFQDIL		VLTRPVTRNE		RHSYQVYRQP		IPVQELVLED		LQDGDVRMGG
SFRGAFSNSE		KAKNIFRIRF		HDPSPAQSHT		LQANDVFHKQ		QWFNCIRAAI
APFQSAGSPP		ELQGLPELHE		ECEGNHPSAR		KLTAQRRAST		VSSVTQVEVD
ENAYRCGSGM		QMAEDSKSLK		THQTQPGIRR		ARDKALSGGK		RKETLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Srougi M.C., Burridge K. (2011). The nuclear guanine nucleotide exchange factors Ect2 and Net1 regulate RhoB-mediated cell death after DNA damage. PLoS ONE. 6: E17108—E17108. PMID 21373644 DOI:10.1371/journal.pone.0017108
• Chan A.M.-L., Takai S., Yamada K., Miki T. (1996). Isolation of a novel oncogene, NET1, from neuroepithelioma cells by expression cDNA cloning. Oncogene. 12: 1259—1266. PMID 8649828

Див. також

• Хромосома 10