NIF3L1

NIF3L1
Ідентифікатори
Символи	NIF3L1, ALS2CR1, CALS-7, MDS015, NGG1 interacting factor 3 like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605778 MGI: 1929485 HomoloGene: 5881 GeneCards: NIF3L1
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • мітохондрія Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60491	65102
Ensembl	ENSG00000196290	ENSMUSG00000026036
UniProt	Q9GZT8	Q9EQ80
RefSeq (мРНК)	NM_001136039 NM_001142355 NM_001142356 NM_021824 NM_001369441 NM_001369442 NM_001369443 NM_001369444 NM_001369445	NM_022988
RefSeq (білок)	NP_001129511 NP_001135827 NP_001135828 NP_068596 NP_001356370 NP_001356371 NP_001356372 NP_001356373 NP_001356374	NP_075364
Локус (UCSC)	Хр. 2: 200.89 – 200.9 Mb	Хр. 1: 58.48 – 58.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NIF3L1 (англ. NGG1 interacting factor 3 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 41 968.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSSCVRPVP		TTVRFVDSLI		CNSSRSFMDL		KALLSSLNDF		ASLSFAESWD
NVGLLVEPSP		PHTVNTLFLT		NDLTEEVMEE		VLQKKADLIL		SYHPPIFRPM
KRITWNTWKE		RLVIRALENR		VGIYSPHTAY		DAAPQGVNNW		LAKGLGACTS
RPIHPSKAPN		YPTEGNHRVE		FNVNYTQDLD		KVMSAVKGID		GVSVTSFSAR
TGNEEQTRIN		LNCTQKALMQ		VVDFLSRNKQ		LYQKTEILSL		EKPLLLHTGM
GRLCTLDESV		SLATMIDRIK		RHLKLSHIRL		ALGVGRTLES		QVKVVALCAG
SGSSVLQGVE		ADLYLTGEMS		HHDTLDAASQ		GINVILCEHS		NTERGFLSDL
RDMLDSHLEN		KINIILSETD		RDPLQVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tascou S., Kang T.W., Trappe R., Engel W., Burfeind P. (2003). Identification and characterization of NIF3L1 BP1, a novel cytoplasmic interaction partner of the NIF3L1 protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309: 440—448. PMID 12951069 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.07.008

Див. також

• Хромосома 2