NKD2

NKD2
Ідентифікатори
Символи	NKD2, Naked2, Naked cuticle 2, naked cuticle homolog 2, WNT signaling pathway inhibitor, NKD inhibitor of WNT signaling pathway 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607852 MGI: 1919543 HomoloGene: 12459 GeneCards: NKD2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • growth factor binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • myosin heavy chain binding • ATPase binding Клітинна компонента • цитоплазма • lateral plasma membrane • мембрана • basolateral plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • cell periphery • клітинна мембрана • exocytic vesicle Біологічний процес • Wnt signaling pathway • positive regulation of protein processing • Golgi vesicle fusion to target membrane • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • екзоцитоз • protein localization to plasma membrane • positive regulation of protein localization to plasma membrane • negative regulation of Wnt signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85409	72293
Ensembl	ENSG00000145506 ENSG00000276920	ENSMUSG00000021567
UniProt	Q969F2	Q8VE28
RefSeq (мРНК)	NM_001271082 NM_033120	NM_028186 NM_001347535
RefSeq (білок)	NP_001258011 NP_149111	NP_001334464 NP_082462
Локус (UCSC)	Хр. 5: 1.01 – 1.04 Mb	Хр. 13: 73.97 – 74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NKD2 (англ. Naked cuticle homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 50 055.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKLQSKHAA		AARKRRESPE		GDSFVASAYA		SGRKGAEEAE		RRARDKQELP
NGDPKEGPFR		EDQCPLQVAL		PAEKAEGREH		PGQLLSADDG		ERAANREGPR
GPGGQRLNID		ALQCDVSVEE		DDRQEWTFTL		YDFDNCGKVT		REDMSSLMHT
IYEVVDASVN		HSSGSSKTLR		VKLTVSPEPS		SKRKEGPPAG		QDREPTRCRM
EGELAEEPRV		ADRRLSAHVR		RPSTDPQPCS		ERGPYCVDEN		TERRNHYLDL
AGIENYTSRF		GPGSPPVQAK		QEPQGRASHL		QARSRSQEPD		THAVHHRRSQ
VLVEHVVPAS		EPAARALDTQ		PRPKGPEKQF		LKSPKGSGKP		PGVPASSKSG
KAFSYYLPAV		LPPQAPQDGH		HLPQPPPPPY		GHKRYRQKGR		EGHSPLKAPH
AQPATVEHEV		VRDLPPTPAG		EGYAVPVIQR		HEHHHHHEHH		HHHHHHHFHP
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, сигнальний шлях Wnt, екзоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Wharton K.A. Jr., Zimmermann G., Rousset R., Scott M.P. (2001). Vertebrate proteins related to Drosophila Naked Cuticle bind Dishevelled and antagonize Wnt signaling. Dev. Biol. 234: 93—106. PMID 11356022 DOI:10.1006/dbio.2001.0238
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hu T., Krezel A.M., Li C., Coffey R.J. (2006). Structural studies of human Naked2: a biologically active intrinsically unstructured protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 911—915. PMID 17045239 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.121
• Katoh M. (2001). Molecular cloning, gene structure, and expression analyses of NKD1 and NKD2. Int. J. Oncol. 19: 963—969. PMID 11604995

Див. також

• Хромосома 5