NLRP12

NLRP12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L6A, 4XHS
Ідентифікатори
Символи	NLRP12, CLR19.3, FCAS2, NALP12, PAN6, PYPAF7, RNO, RNO2, NLR family, pyrin domain containing 12, NLR family pyrin domain containing 12
Зовнішні ІД	OMIM: 609648 MGI: 2676630 HomoloGene: 16972 GeneCards: NLRP12
Пов'язані генетичні захворювання
familial cold autoinflammatory syndrome 2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • dendritic cell migration • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of Toll signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling • negative regulation of inflammatory response • cellular response to cytokine stimulus • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of inflammatory response • negative regulation of protein autophosphorylation • positive regulation of MHC class I biosynthetic process • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of signal transduction • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91662	378425
Ensembl	ENSG00000142405	ENSMUSG00000078817
UniProt	P59046	E9Q5R7
RefSeq (мРНК)	NM_001277126 NM_001277129 NM_033297 NM_144687	NM_001033431
RefSeq (білок)	NP_001264055 NP_001264058 NP_653288	NP_001028603
Локус (UCSC)	Хр. 19: 53.79 – 53.82 Mb	Хр. 7: 3.27 – 3.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NLRP12 (англ. NLR family pyrin domain containing 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 061 амінокислот, а молекулярна маса — 120 173.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRTAGRDGL		CRLSTYLEEL		EAVELKKFKL		YLGTATELGE		GKIPWGSMEK
AGPLEMAQLL		ITHFGPEEAW		RLALSTFERI		NRKDLWERGQ		REDLVRDTPP
GGPSSLGNQS		TCLLEVSLVT		PRKDPQETYR		DYVRRKFRLM		EDRNARLGEC
VNLSHRYTRL		LLVKEHSNPM		QVQQQLLDTG		RGHARTVGHQ		ASPIKIETLF
EPDEERPEPP		RTVVMQGAAG		IGKSMLAHKV		MLDWADGKLF		QGRFDYLFYI
NCREMNQSAT		ECSMQDLIFS		CWPEPSAPLQ		ELIRVPERLL		FIIDGFDELK
PSFHDPQGPW		CLCWEEKRPT		ELLLNSLIRK		KLLPELSLLI		TTRPTALEKL
HRLLEHPRHV		EILGFSEAER		KEYFYKYFHN		AEQAGQVFNY		VRDNEPLFTM
CFVPLVCWVV		CTCLQQQLEG		GGLLRQTSRT		TTAVYMLYLL		SLMQPKPGAP
RLQPPPNQRG		LCSLAADGLW		NQKILFEEQD		LRKHGLDGED		VSAFLNMNIF
QKDINCERYY		SFIHLSFQEF		FAAMYYILDE		GEGGAGPDQD		VTRLLTEYAF
SERSFLALTS		RFLFGLLNEE		TRSHLEKSLC		WKVSPHIKMD		LLQWIQSKAQ
SDGSTLQQGS		LEFFSCLYEI		QEEEFIQQAL		SHFQVIVVSN		IASKMEHMVS
SFCLKRCRSA		QVLHLYGATY		SADGEDRARC		SAGAHTLLVQ		LPERTVLLDA
YSEHLAAALC		TNPNLIELSL		YRNALGSRGV		KLLCQGLRHP		NCKLQNLRLK
RCRISSSACE		DLSAALIANK		NLTRMDLSGN		GVGFPGMMLL		CEGLRHPQCR
LQMIQLRKCQ		LESGACQEMA		SVLGTNPHLV		ELDLTGNALE		DLGLRLLCQG
LRHPVCRLRT		LWLKICRLTA		AACDELASTL		SVNQSLRELD		LSLNELGDLG
VLLLCEGLRH		PTCKLQTLRL		GICRLGSAAC		EGLSVVLQAN		HNLRELDLSF
NDLGDWGLWL		LAEGLQHPAC		RLQKLWLDSC		GLTAKACENL		YFTLGINQTL
TDLYLTNNAL		GDTGVRLLCK		RLSHPGCKLR		VLWLFGMDLN		KMTHSRLAAL
RVTKPYLDIG		C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019
• Shami P.J., Kanai N., Wang L.Y., Vreeke T.M., Parker C.J. (2001). Identification and characterization of a novel gene that is upregulated in leukaemia cells by nitric oxide. Br. J. Haematol. 112: 138—147. PMID 11167794 DOI:10.1046/j.1365-2141.2001.02491.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pinheiro A.S., Eibl C., Ekman-Vural Z., Schwarzenbacher R., Peti W. (2011). The NLRP12 pyrin domain: structure, dynamics, and functional insights. J. Mol. Biol. 413: 790—803. PMID 21978668 DOI:10.1016/j.jmb.2011.09.024

Див. також

• Хромосома 19