NLRP4

NLRP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4EWI
Ідентифікатори
Символи	NLRP4, CLR19.5, CT58, NALP4, PAN2, PYPAF4, RNH2, NLR family, pyrin domain containing 4, NLR family pyrin domain containing 4
Зовнішні ІД	OMIM: 609645 MGI: 1890518 HomoloGene: 75315 GeneCards: NLRP4
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATP binding Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • inflammatory response • regulation of type I interferon production Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	147945	83564
Ensembl	ENSG00000160505	ENSMUSG00000034690
UniProt	Q96MN2	Q3TKR3
RefSeq (мРНК)	NM_134444	NM_031389
RefSeq (білок)	NP_604393	NP_113566
Локус (UCSC)	Хр. 19: 55.84 – 55.88 Mb	Хр. 7: 6.05 – 6.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NLRP4 (англ. NLR family pyrin domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 994 амінокислот, а молекулярна маса — 113 415.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASFFSDFG		LMWYLEELKK		EEFRKFKEHL		KQMTLQLELK		QIPWTEVKKA
SREELANLLI		KHYEEQQAWN		ITLRIFQKMD		RKDLCMKVMR		ERTGYTKTYQ
AHAKQKFSRL		WSSKSVTEIH		LYFEEEVKQE		ECDHLDRLFA		PKEAGKQPRT
VIIQGPQGIG		KTTLLMKLMM		AWSDNKIFRD		RFLYTFYFCC		RELRELPPTS
LADLISREWP		DPAAPITEIV		SQPERLLFVI		DSFEELQGGL		NEPDSDLCGD
LMEKRPVQVL		LSSLLRKKML		PEASLLIAIK		PVCPKELRDQ		VTISEIYQPR
GFNESDRLVY		FCCFFKDPKR		AMEAFNLVRE		SEQLFSICQI		PLLCWILCTS
LKQEMQKGKD		LALTCQSTTS		VYSSFVFNLF		TPEGAEGPTP		QTQHQLKALC
SLAAEGMWTD		TFEFCEDDLR		RNGVVDADIP		ALLGTKILLK		YGERESSYVF
LHVCIQEFCA		ALFYLLKSHL		DHPHPAVRCV		QELLVANFEK		ARRAHWIFLG
CFLTGLLNKK		EQEKLDAFFG		FQLSQEIKQQ		IHQCLKSLGE		RGNPQGQVDS
LAIFYCLFEM		QDPAFVKQAV		NLLQEANFHI		IDNVDLVVSA		YCLKYCSSLR
KLCFSVQNVF		KKEDEHSSTS		DYSLICWHHI		CSVLTTSGHL		RELQVQDSTL
SESTFVTWCN		QLRHPSCRLQ		KLGINNVSFS		GQSVLLFEVL		FYQPDLKYLS
FTLTKLSRDD		IRSLCDALNY		PAGNVKELAL		VNCHLSPIDC		EVLAGLLTNN
KKLTYLNVSC		NQLDTGVPLL		CEALCSPDTV		LVYLMLAFCH		LSEQCCEYIS
EMLLRNKSVR		YLDLSANVLK		DEGLKTLCEA		LKHPDCCLDS		LCLVKCFITA
AGCEDLASAL		ISNQNLKILQ		IGCNEIGDVG		VQLLCRALTH		TDCRLEILGL
EECGLTSTCC		KDLASVLTCS		KTLQQLNLTL		NTLDHTGVVV		LCEALRHPEC
ALQVLGLRKT		DFDEETQALL		TAEEERNPNL		TITDDCDTIT		RVEI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19