NLRP9

NLRP9
Ідентифікатори
Символи	NLRP9, CLR19.1, NALP9, NOD6, PAN12, NLR family, pyrin domain containing 9, NLR family pyrin domain containing 9
Зовнішні ІД	OMIM: 609663 MGI: 2675377 HomoloGene: 18530 GeneCards: NLRP9
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • inflammasome complex Біологічний процес • positive regulation of interleukin-18 production • defense response to virus • Піроптоз • процес імунної системи • inflammatory response • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	338321	243874
Ensembl	ENSG00000185792	ENSMUSG00000060508
UniProt	Q7RTR0	Q66X22
RefSeq (мРНК)	NM_176820	NM_194058
RefSeq (білок)	NP_789790	NP_918947
Локус (UCSC)	Хр. 19: 55.71 – 55.74 Mb	Хр. 7: 19.73 – 19.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NLRP9 (англ. NLR family pyrin domain containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 991 амінокислот, а молекулярна маса — 113 312.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAESFFSDFG		LLWYLKELRK		EEFWKFKELL		KQPLEKFELK		PIPWAELKKA
SKEDVAKLLD		KHYPGKQAWE		VTLNLFLQIN		RKDLWTKAQE		EMRNKLNPYR
KHMKETFQLI		WEKETCLHVP		EHFYKETMKN		EYKELNDAYT		AAARRHTVVL
EGPDGIGKTT		LLRKVMLDWA		EGNLWKDRFT		FVFFLNVCEM		NGIAETSLLE
LLSRDWPESS		EKIEDIFSQP		ERILFIMDGF		EQLKFNLQLK		ADLSDDWRQR
QPMPIILSSL		LQKKMLPESS		LLIALGKLAM		QKHYFMLRHP		KLIKLLGFSE
SEKKSYFSYF		FGEKSKALKV		FNFVRDNGPL		FILCHNPFTC		WLVCTCVKQR
LERGEDLEIN		SQNTTYLYAS		FLTTVFKAGS		QSFPPKVNRA		RLKSLCALAA
EGIWTYTFVF		SHGDLRRNGL		SESEGVMWVG		MRLLQRRGDC		FAFMHLCIQE
FCAAMFYLLK		RPKDDPNPAI		GSITQLVRAS		VVQPQTLLTQ		VGIFMFGIST
EEIVSMLETS		FGFPLSKDLK		QEITQCLESL		SQCEADREAI		AFQELFIGLF
ETQEKEFVTK		VMNFFEEVFI		YIGNIEHLVI		ASFCLKHCQH		LTTLRMCVEN
IFPDDSGCIS		DYNEKLVYWR		ELCSMFITNK		NFQILDMENT		SLDDPSLAIL
CKALAQPVCK		LRKLIFTSVY		FGHDSELFKA		VLHNPHLKLL		SLYGTSLSQS
DIRHLCETLK		HPMCKIEELI		LGKCDISSEV		CEDIASVLAC		NSKLKHLSLV
ENPLRDEGMT		LLCEALKHSH		CALERLMLMY		CCLTSVSCDS		ISEVLLCSKS
LSLLDLGSNA		LEDNGVASLC		AALKHPGCSI		RELWLMGCFL		TSDSCKDIAA
VLICNGKLKT		LKLGHNEIGD		TGVRQLCAAL		QHPHCKLECL		GLQTCPITRA
CCDDIAAALI		ACKTLRSLNL		DWIALDADAV		VVLCEALSHP		DCALQMLGLH
KSGFDEETQK		ILMSVEEKIP		HLTISHGPWI		DEEYKIRGVL		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Inohara N., Nunez G. (2003). NODs: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis. Nat. Rev. Immunol. 3: 371—382. PMID 12766759 DOI:10.1038/nri1086

Див. також

• Хромосома 19