NMD3

NMD3
Ідентифікатори
Символи	NMD3, CGI-07, NMD3 ribosome export adaptor
Зовнішні ІД	OMIM: 611021 MGI: 2140103 HomoloGene: 6127 GeneCards: NMD3
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • RNA binding • ribosomal large subunit binding Клітинна компонента • клітинне ядро • мембрана • ядерце • цитоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • protein transport • ribosomal large subunit export from nucleus • positive regulation of RNA biosynthetic process • positive regulation of protein localization to nucleolus • positive regulation of protein binding • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51068	97112
Ensembl	ENSG00000169251	ENSMUSG00000027787
UniProt	Q96D46	Q99L48
RefSeq (мРНК)	NM_015938 NM_001320227	NM_133787
RefSeq (білок)	NP_001307156 NP_057022	NP_598548
Локус (UCSC)	Хр. 3: 161.1 – 161.25 Mb	Хр. 3: 69.63 – 69.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NMD3 (англ. NMD3 ribosome export adaptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот, а молекулярна маса — 57 603.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEYMAESTDR		SPGHILCCEC		GVPISPNPAN		ICVACLRSKV		DISQGIPKQV
SISFCKQCQR		YFQPPGTWIQ		CALESRELLA		LCLKKIKAPL		SKVRLVDAGF
VWTEPHSKRL		KVKLTIQKEV		MNGAILQQVF		VVDYVVQSQM		CGDCHRVEAK
DFWKAVIQVR		QKTLHKKTFY		YLEQLILKYG		MHQNTLRIKE		IHDGLDFYYS
SKQHAQKMVE		FLQCTVPCRY		KASQRLISQD		IHSNTYNYKS		TFSVEIVPIC
KDNVVCLSPK		LAQSLGNMNQ		ICVCIRVTSA		IHLIDPNTLQ		VADIDGSTFW
SHPFNSLCHP		KQLEEFIVME		CSIVQDIKRA		AGAGMISKKH		TLGEVWVQKT
SEMNTDKQYF		CRTHLGHLLN		PGDLVLGFDL		ANCNLNDEHV		NKMNSDRVPD
VVLIKKSYDR		TKRQRRRNWK		LKELAREREN		MDTDDERQYQ		DFLEDLEEDE
AIRKNVNIYR		DSAIPVESDT		DDEGAPRISL		AEMLEDLHIS		QDATGEEGAS
MLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Thomas F., Kutay U. (2003). Biogenesis and nuclear export of ribosomal subunits in higher eukaryotes depend on the CRM1 export pathway. J. Cell Sci. 116: 2409—2419. PMID 12724356 DOI:10.1242/jcs.00464
• Trotta C.R., Lund E., Kahan L., Johnson A.W., Dahlberg J.E. (2003). Coordinated nuclear export of 60S ribosomal subunits and NMD3 in vertebrates. EMBO J. 22: 2841—2851. PMID 12773398 DOI:10.1093/emboj/cdg249

Див. також

• Хромосома 3