NOLC1

NOLC1
Ідентифікатори
Символи	NOLC1, NOPP130, NOPP140, NS5ATP13, P130, Nucleolar phosphoprotein p130, nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, Srp40
Зовнішні ІД	OMIM: 602394 HomoloGene: 68818 GeneCards: NOLC1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding • RNA polymerase I core binding • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • nuclear localization sequence binding • protein domain specific binding • box C/D RNA binding • box H/ACA snoRNA binding • box C/D snoRNP complex binding • box H/ACA snoRNP complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • Тільце Кахаля • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • fibrillar center • box C/D RNP complex • box H/ACA snoRNP complex Біологічний процес • rRNA processing • клітинний цикл • GO:0007576 nucleolus organization • regulation of translation • neural crest formation • neural crest cell development • GO:0007067 мітоз • response to osmotic stress • positive regulation of cell population proliferation • box H/ACA RNA metabolic process • regulation of protein import into nucleus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9221	64896
Ensembl	ENSG00000166197	ENSRNOG00000018704
UniProt	Q14978	P41777
RefSeq (мРНК)	NM_001284388 NM_001284389 NM_004741	NM_022869
RefSeq (білок)	NP_001271317 NP_001271318 NP_004732	NP_074060
Локус (UCSC)	Хр. 10: 102.15 – 102.16 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOLC1 (англ. Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 699 амінокислот, а молекулярна маса — 73 603.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADAGIRRVV		PSDLYPLVLG		FLRDNQLSEV		ANKFAKATGA		TQQDANASSL
LDIYSFWLKS		AKVPERKLQA		NGPVAKKAKK		KASSSDSEDS		SEEEEEVQGP
PAKKAAVPAK		RVGLPPGKAA		AKASESSSSE		ESSDDDDEED		QKKQPVQKGV
KPQAKAAKAP		PKKAKSSDSD		SDSSSEDEPP		KNQKPKITPV		TVKAQTKAPP
KPARAAPKIA		NGKAASSSSS		SSSSSSSDDS		EEEKAAATPK		KTVPKKQVVA
KAPVKAATTP		TRKSSSSEDS		SSDEEEEQKK		PMKNKPGPYS		SVPPPSAPPP
KKSLGTQPPK		KAVEKQQPVE		SSEDSSDESD		SSSEEEKKPP		TKAVVSKATT
KPPPAKKAAE		SSSDSSDSDS		SEDDEAPSKP		AGTTKNSSNK		PAVTTKSPAV
KPAAAPKQPV		GGGQKLLTRK		ADSSSSEEES		SSSEEEKTKK		MVATTKPKAT
AKAALSLPAK		QAPQGSRDSS		SDSDSSSSEE		EEEKTSKSAV		KKKPQKVAGG
AAPSKPASAK		KGKAESSNSS		SSDDSSEEEE		EKLKGKGSPR		PQAPKANGTS
ALTAQNGKAA		KNSEEEEEEK		KKAAVVVSKS		GSLKKRKQNE		AAKEAETPQA
KKIKLQTPNT		FPKRKKGEKR		ASSPFRRVRE		EEIEVDSRVA		DNSFDAKRGA
AGDWGERANQ		VLKFTKGKSF		RHEKTKKKRG		SYRGGSISVQ		VNSIKFDSE

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pai C.-Y., Yeh N.-H. (1996). Cell proliferation-dependent expression of two isoforms of the nucleolar phosphoprotein p130. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 581—587. PMID 8630004 DOI:10.1006/bbrc.1996.0639
• Chen H.-K., Yeh N.-H. (1997). The nucleolar phosphoprotein P130 is a GTPase/ATPase with intrinsic property to form large complexes triggered by F- and Mg2+. Biochem. Biophys. Res. Commun. 230: 370—375. PMID 9016786 DOI:10.1006/bbrc.1996.5966
• Chen H.-K., Pai C.-Y., Huang J.-Y., Yeh N.-H. (1999). Human Nopp140, which interacts with RNA polymerase I: implications for rRNA gene transcription and nucleolar structural organization. Mol. Cell. Biol. 19: 8536—8546. PMID 10567578 DOI:10.1128/MCB.19.12.8536
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 10