NOP2

NOP2
Ідентифікатори
Символи	NOP2, NOL1, NOP120, NSUN1, p120, NOP2 nucleolar protein
Зовнішні ІД	OMIM: 164031 MGI: 107891 HomoloGene: 135865 GeneCards: NOP2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • нуклеоплазма Біологічний процес • rRNA processing • Метилювання • rRNA base methylation • maturation of LSU-rRNA • positive regulation of cell population proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • ribosomal large subunit assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator • ribosome biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4839	110109
Ensembl	ENSG00000111641	ENSMUSG00000038279
UniProt	P46087	Q922K7
RefSeq (мРНК)	NM_001033714 NM_001258308 NM_001258309 NM_001258310 NM_006170	NM_138747
RefSeq (білок)	NP_001028886 NP_001245237 NP_001245238 NP_001245239 NP_006161	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 6.56 – 6.57 Mb	Хр. 6: 125.11 – 125.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOP2 (англ. NOP2 nucleolar protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 812 амінокислот, а молекулярна маса — 89 302.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRKLDPTKE		KRGPGRKARK		QKGAETELVR		FLPAVSDENS		KRLSSRARKR
AAKRRLGSVE		APKTNKSPEA		KPLPGKLPKG		ISAGAVQTAG		KKGPQSLFNA
PRGKKRPAPG		SDEEEEEEDS		EEDGMVNHGD		LWGSEDDADT		VDDYGADSNS
EDEEEGEALL		PIERAARKQK		AREAAAGIQW		SEEETEDEEE		EKEVTPESGP
PKVEEADGGL		QINVDEEPFV		LPPAGEMEQD		AQAPDLQRVH		KRIQDIVGIL
RDFGAQREEG		RSRSEYLNRL		KKDLAIYYSY		GDFLLGKLMD		LFPLSELVEF
LEANEVPRPV		TLRTNTLKTR		RRDLAQALIN		RGVNLDPLGK		WSKTGLVVYD
SSVPIGATPE		YLAGHYMLQG		ASSMLPVMAL		APQEHERILD		MCCAPGGKTS
YMAQLMKNTG		VILANDANAE		RLKSVVGNLH		RLGVTNTIIS		HYDGRQFPKV
VGGFDRVLLD		APCSGTGVIS		KDPAVKTNKD		EKDILRCAHL		QKELLLSAID
SVNATSKTGG		YLVYCTCSIT		VEENEWVVDY		ALKKRNVRLV		PTGLDFGQEG
FTRFRERRFH		PSLRSTRRFY		PHTHNMDGFF		IAKFKKFSNS		IPQSQTGNSE
TATPTNVDLP		QVIPKSENSS		QPAKKAKGAA		KTKQQLQKQQ		HPKKASFQKL
NGISKGADSE		LSTVPSVTKT		QASSSFQDSS		QPAGKAEGIR		EPKVTGKLKQ
RSPKLQSSKK		VAFLRQNAPP		KGTDTQTPAV		LSPSKTQATL		KPKDHHQPLG
RAKGVEKQQL		PEQPFEKAAF		QKQNDTPKGP		QPPTVSPIRS		SRPPPAKRKK
SQSRGNSQLL		LS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ren Y., Busch R.K., Perlaky L., Busch H. (1998). The 58-kDa microspherule protein (MSP58), a nucleolar protein, interacts with nucleolar protein p120. Eur. J. Biochem. 253: 734—742. PMID 9654073 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2530734.x
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049
• Sharma S., Yang J., Watzinger P., Kotter P., Entian K.D. (2013). Yeast Nop2 and Rcm1 methylate C2870 and C2278 of the 25S rRNA, respectively. Nucleic Acids Res. 41: 9062—9076. PMID 23913415 DOI:10.1093/nar/gkt679
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 12