NOP56

NOP56
Ідентифікатори
Символи	NOP56, NOL5A, SCA36, NOP56 ribonucleoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 614154 MGI: 1914384 HomoloGene: 4660 GeneCards: NOP56
Пов'язані генетичні захворювання
spinocerebellar ataxia type 36
Онтологія гена Молекулярна функція • histone methyltransferase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snoRNA binding • RNA binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • box C/D RNP complex • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • small-subunit processome • pre-snoRNP complex • мембрана • клітинне ядро • Нуклеоплазма • fibrillar center • ядерце Біологічний процес • rRNA processing • rRNA modification • ribosome biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10528	67134
Ensembl	ENSG00000101361	ENSMUSG00000027405
UniProt	O00567	Q9D6Z1
RefSeq (мРНК)	NM_006392	NM_024193
RefSeq (білок)	NP_006383	NP_077155
Локус (UCSC)	Хр. 20: 2.65 – 2.66 Mb	Хр. 2: 130.12 – 130.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOP56 (англ. NOP56 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 050.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLLHVLFEH		AVGYALLALK		EVEEISLLQP		QVEESVLNLG		KFHSIVRLVA
FCPFASSQVA		LENANAVSEG		VVHEDLRLLL		ETHLPSKKKK		VLLGVGDPKI
GAAIQEELGY		NCQTGGVIAE		ILRGVRLHFH		NLVKGLTDLS		ACKAQLGLGH
SYSRAKVKFN		VNRVDNMIIQ		SISLLDQLDK		DINTFSMRVR		EWYGYHFPEL
VKIINDNATY		CRLAQFIGNR		RELNEDKLEK		LEELTMDGAK		AKAILDASRS
SMGMDISAID		LINIESFSSR		VVSLSEYRQS		LHTYLRSKMS		QVAPSLSALI
GEAVGARLIA		HAGSLTNLAK		YPASTVQILG		AEKALFRALK		TRGNTPKYGL
IFHSTFIGRA		AAKNKGRISR		YLANKCSIAS		RIDCFSEVPT		SVFGEKLREQ
VEERLSFYET		GEIPRKNLDV		MKEAMVQAEE		AAAEITRKLE		KQEKKRLKKE
KKRLAALALA		SSENSSSTPE		ECEEMSEKPK		KKKKQKPQEV		PQENGMEDPS
ISFSKPKKKK		SFSKEELMSS		DLEETAGSTS		IPKRKKSTPK		EETVNDPEEA
GHRSGSKKKR		KFSKEEPVSS		GPEEAVGKSS		SKKKKKFHKA		SQED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Gautier T., Berges T., Tollervey D., Hurt E. (1997). Nucleolar KKE/D repeat proteins Nop56p and Nop58p interact with Nop1p and are required for ribosome biogenesis. Mol. Cell. Biol. 17: 7088—7098. PMID 9372940 DOI:10.1128/MCB.17.12.7088
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Watkins N.J., Dickmanns A., Luhrmann R. (2002). Conserved stem II of the box C/D motif is essential for nucleolar localization and is required, along with the 15.5K protein, for the hierarchical assembly of the box C/D snoRNP. Mol. Cell. Biol. 22: 8342—8352. PMID 12417735 DOI:10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
• McKeegan K.S., Debieux C.M., Boulon S., Bertrand E., Watkins N.J. (2007). A dynamic scaffold of pre-snoRNP factors facilitates human box C/D snoRNP assembly. Mol. Cell. Biol. 27: 6782—6793. PMID 17636026 DOI:10.1128/MCB.01097-07
• McKeegan K.S., Debieux C.M., Watkins N.J. (2009). Evidence that the AAA+ proteins TIP48 and TIP49 bridge interactions between 15.5K and the related NOP56 and NOP58 proteins during box C/D snoRNP biogenesis. Mol. Cell. Biol. 29: 4971—4981. PMID 19620283 DOI:10.1128/MCB.00752-09

Див. також

• Хромосома 20