NOP58

NOP58
Ідентифікатори
Символи	NOP58, NOP5, NOP5/HSPC120, NOP58 ribonucleoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 616742 MGI: 1933184 HomoloGene: 7024 GeneCards: NOP58
Онтологія гена Молекулярна функція • ATPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TFIID-class transcription factor complex binding • snoRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • small-subunit processome • Тільце Кахаля • pre-snoRNP complex • мембрана • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • box C/D RNP complex • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • fibrillar center • гіалоплазма Біологічний процес • ribosome biogenesis • snoRNA localization • cell growth • rRNA processing • rRNA modification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51602	55989
Ensembl	ENSG00000055044	ENSMUSG00000026020
UniProt	Q9Y2X3	Q6DFW4
RefSeq (мРНК)	NM_015934	NM_018868
RefSeq (білок)	NP_057018	NP_061356
Локус (UCSC)	Хр. 2: 202.27 – 202.3 Mb	Хр. 1: 59.72 – 59.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOP58 (англ. NOP58 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 59 578.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLVLFETSVG		YAIFKVLNEK		KLQEVDSLWK		EFETPEKANK		IVKLKHFEKF
QDTAEALAAF		TALMEGKINK		QLKKVLKKIV		KEAHEPLAVA		DAKLGGVIKE
KLNLSCIHSP		VVNELMRGIR		SQMDGLIPGV		EPREMAAMCL		GLAHSLSRYR
LKFSADKVDT		MIVQAISLLD		DLDKELNNYI		MRCREWYGWH		FPELGKIISD
NLTYCKCLQK		VGDRKNYASA		KLSELLPEEV		EAEVKAAAEI		SMGTEVSEED
ICNILHLCTQ		VIEISEYRTQ		LYEYLQNRMM		AIAPNVTVMV		GELVGARLIA
HAGSLLNLAK		HAASTVQILG		AEKALFRALK		SRRDTPKYGL		IYHASLVGQT
SPKHKGKISR		MLAAKTVLAI		RYDAFGEDSS		SAMGVENRAK		LEARLRTLED
RGIRKISGTG		KALAKTEKYE		HKSEVKTYDP		SGDSTLPTCS		KKRKIEQVDK
EDEITEKKAK		KAKIKVKVEE		EEEEKVAEEE		ETSVKKKKKR		GKKKHIKEEP
LSEEEPCTST		AIASPEKKKK		KKKKRENED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як біогенез рибосом. Локалізований у ядрі.

Література

• Lyman S.K., Gerace L., Baserga S.J. (1999). Human Nop5/Nop58 is a component common to the box C/D small nucleolar ribonucleoproteins. RNA. 5: 1597—1604. PMID 10606270 DOI:10.1017/S1355838299991288
• Nelson S.A., Santora K.E., LaRochelle W.J. (2000). Isolation and characterization of a novel PDGF-induced human gene. Gene. 253: 87—93. PMID 10925205 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00232-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Watkins N.J., Dickmanns A., Luhrmann R. (2002). Conserved stem II of the box C/D motif is essential for nucleolar localization and is required, along with the 15.5K protein, for the hierarchical assembly of the box C/D snoRNP. Mol. Cell. Biol. 22: 8342—8352. PMID 12417735 DOI:10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002
• McKeegan K.S., Debieux C.M., Boulon S., Bertrand E., Watkins N.J. (2007). A dynamic scaffold of pre-snoRNP factors facilitates human box C/D snoRNP assembly. Mol. Cell. Biol. 27: 6782—6793. PMID 17636026 DOI:10.1128/MCB.01097-07
• Watkins N.J., Lemm I., Luhrmann R. (2007). Involvement of nuclear import and export factors in U8 box C/D snoRNP biogenesis. Mol. Cell. Biol. 27: 7018—7027. PMID 17709390 DOI:10.1128/MCB.00516-07

Див. також

• Хромосома 2