NPLOC4

NPLOC4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PJH
Ідентифікатори
Символи	NPLOC4, NPL4, NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor
Зовнішні ІД	OMIM: 606590 MGI: 2679787 HomoloGene: 5403 GeneCards: NPLOC4
Онтологія гена Молекулярна функція • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear outer membrane-endoplasmic reticulum membrane network • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • UFD1-NPL4 complex • нуклеоплазма • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex Біологічний процес • error-free translesion synthesis • retrograde protein transport, ER to cytosol • Golgi organization • ubiquitin-dependent ERAD pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55666	217365
Ensembl	ENSG00000182446	ENSMUSG00000039703
UniProt	Q8TAT6	P60670
RefSeq (мРНК)	NM_017921 NM_001369698	NM_001195023 NM_199469
RefSeq (білок)	NP_060391 NP_001356627 NP_060391.2	NP_001181952 NP_955763
Локус (UCSC)	Хр. 17: 81.56 – 81.65 Mb	Хр. 11: 120.27 – 120.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NPLOC4 (англ. NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 608 амінокислот, а молекулярна маса — 68 120.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAESIIIRVQ		SPDGVKRITA		TKRETAATFL		KKVAKEFGFQ		NNGFSVYINR
NKTGEITASS		NKSLNLLKIK		HGDLLFLFPS		SLAGPSSEME		TSVPPGFKVF
GAPNVVEDEI		DQYLSKQDGK		IYRSRDPQLC		RHGPLGKCVH		CVPLEPFDED
YLNHLEPPVK		HMSFHAYIRK		LTGGADKGKF		VALENISCKI		KSGCEGHLPW
PNGICTKCQP		SAITLNRQKY		RHVDNIMFEN		HTVADRFLDF		WRKTGNQHFG
YLYGRYTEHK		DIPLGIRAEV		AAIYEPPQIG		TQNSLELLED		PKAEVVDEIA
AKLGLRKVGW		IFTDLVSEDT		RKGTVRYSRN		KDTYFLSSEE		CITAGDFQNK
HPNMCRLSPD		GHFGSKFVTA		VATGGPDNQV		HFEGYQVSNQ		CMALVRDECL
LPCKDAPELG		YAKESSSEQY		VPDVFYKDVD		KFGNEITQLA		RPLPVEYLII
DITTTFPKDP		VYTFSISQNP		FPIENRDVLG		ETQDFHSLAT		YLSQNTSSVF
LDTISDFHLL		LFLVTNEVMP		LQDSISLLLE		AVRTRNEELA		QTWKRSEQWA
TIEQLCSTVG		GQLPGLHEYG		AVGGSTHTAT		AAMWACQHCT		FMNQPGTGHC
EMCSLPRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17