NTHL1

NTHL1
Ідентифікатори
Символи	NTHL1, NTH1, OCTS3, hNTH1, FAP3, nth-like DNA glycosylase 1, nth like DNA glycosylase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602656 MGI: 1313275 HomoloGene: 1897 GeneCards: NTHL1
Онтологія гена Молекулярна функція • lyase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • endonuclease activity • double-stranded DNA binding • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • hydrolase activity • DNA binding • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • DNA N-glycosylase activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity • oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • мітохондрія Біологічний процес • depyrimidination • cellular response to DNA damage stimulus • обмін речовин • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair • base-excision repair, AP site formation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4913	18207
Ensembl	ENSG00000065057	ENSMUSG00000041429
UniProt	P78549	O35980
RefSeq (мРНК)	NM_002528 NM_001318193 NM_001318194	NM_008743 NM_001357615
RefSeq (білок)	NP_001305122 NP_001305123 NP_002519	NP_032769 NP_001344544
Локус (UCSC)	Хр. 16: 2.04 – 2.05 Mb	Хр. 17: 24.85 – 24.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NTHL1 (англ. Nth like DNA glycosylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 312 амінокислот, а молекулярна маса — 34 390.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCSPQESGMT		ALSARMLTRS		RSLGPGAGPR		GCREEPGPLR		RREAAAEARK
SHSPVKRPRK		AQRLRVAYEG		SDSEKGEGAE		PLKVPVWEPQ		DWQQQLVNIR
AMRNKKDAPV		DHLGTEHCYD		SSAPPKVRRY		QVLLSLMLSS		QTKDQVTAGA
MQRLRARGLT		VDSILQTDDA		TLGKLIYPVG		FWRSKVKYIK		QTSAILQQHY
GGDIPASVAE		LVALPGVGPK		MAHLAMAVAW		GTVSGIAVDT		HVHRIANRLR
WTKKATKSPE		ETRAALEEWL		PRELWHEING		LLVGFGQQTC		LPVHPRCHAC
LNQALCPAAQ		GL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

• Hilbert T.P., Chaung W., Boorstein R.J., Cunningham R.P., Teebor G.W. (1997). Cloning and expression of the cDNA encoding the human homologue of the DNA repair enzyme, Escherichia coli endonuclease III. J. Biol. Chem. 272: 6733—6740. PMID 9045706 DOI:10.1074/jbc.272.10.6733
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Luna L., Bjoras M., Hoff E., Rognes T., Seeberg E. (2000). Cell-cycle regulation, intracellular sorting and induced overexpression of the human NTH1 DNA glycosylase involved in removal of formamidopyrimidine residues from DNA. Mutat. Res. 460: 95—104. PMID 10882850 DOI:10.1016/S0921-8777(00)00015-X
• Liu X., Roy R. (2002). Truncation of amino-terminal tail stimulates activity of human endonuclease III (hNTH1). J. Mol. Biol. 321: 265—276. PMID 12144783 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00623-X
• Takao M., Aburatani H., Kobayashi K., Yasui A. (1998). Mitochondrial targeting of human DNA glycosylases for repair of oxidative DNA damage. Nucleic Acids Res. 26: 2917—2922. PMID 9611236 DOI:10.1093/nar/26.12.2917
• Dizdaroglu M., Karahalil B., Senturker S., Buckley T.J., Roldan-Arjona T. (1999). Excision of products of oxidative DNA base damage by human NTH1 protein. Biochemistry. 38: 243—246. PMID 9890904 DOI:10.1021/bi9819071

Див. також

• Хромосома 16