NTNG1

NTNG1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZYJ
Ідентифікатори
Символи	NTNG1, Lmnt1, netrin G1
Зовнішні ІД	OMIM: 608818 MGI: 1934028 HomoloGene: 8949 GeneCards: NTNG1
Пов'язані генетичні захворювання
анорексія
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding • cell-cell adhesion mediator activity Клітинна компонента • anchored component of membrane • anchored component of plasma membrane • мембрана • extracellular region • клітинна мембрана • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • anchored component of presynaptic active zone membrane Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • аксоноґенеза • нейробіологія розвитку • C-terminal protein lipidation • modulation of chemical synaptic transmission • synaptic membrane adhesion • motor neuron axon guidance • animal organ morphogenesis • Гістогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22854	80883
Ensembl	ENSG00000162631	ENSMUSG00000059857
UniProt	Q9Y2I2	Q8R4G0
RefSeq (мРНК)	NM_001113226 NM_001113228 NM_001312688 NM_014917 NM_001330665 NM_001372166 NM_001372167 NM_001372168 NM_001372169 NM_001372170 NM_001372171	NM_001163348 NM_001163349 NM_001163350 NM_001163351 NM_030699 NM_133488
RefSeq (білок)	NP_001106697 NP_001106699 NP_001299617 NP_001317594 NP_055732 NP_001359095 NP_001359096 NP_001359097 NP_001359098 NP_001359099 NP_001359100	NP_001156820 NP_001156821 NP_001156822 NP_109624 NP_597995
Локус (UCSC)	Хр. 1: 107.14 – 107.48 Mb	Хр. 3: 109.69 – 110.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NTNG1 (англ. Netrin G1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 539 амінокислот, а молекулярна маса — 60 541.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYLSRFLSIH		ALWVTVSSVM		QPYPLVWGHY		DLCKTQIYTE		EGKVWDYMAC
QPESTDMTKY		LKVKLDPPDI		TCGDPPETFC		AMGNPYMCNN		ECDASTPELA
HPPELMFDFE		GRHPSTFWQS		ATWKEYPKPL		QVNITLSWSK		TIELTDNIVI
TFESGRPDQM		ILEKSLDYGR		TWQPYQYYAT		DCLDAFHMDP		KSVKDLSQHT
VLEIICTEEY		STGYTTNSKI		IHFEIKDRFA		FFAGPRLRNM		ASLYGQLDTT
KKLRDFFTVT		DLRIRLLRPA		VGEIFVDELH		LARYFYAISD		IKVRGRCKCN
LHATVCVYDN		SKLTCECEHN		TTGPDCGKCK		KNYQGRPWSP		GSYLPIPKGT
ANTCIPSISS		IGNCECFGHS		NRCSYIDLLN		TVICVSCKHN		TRGQHCELCR
LGYFRNASAQ		LDDENVCIEC		YCNPLGSIHD		RCNGSGFCEC		KTGTTGPKCD
ECLPGNSWHY		GCQPNVCDNE		LLHCQNGGTC		HNNVRCLCPA		AYTGILCEKL
RCEEAGSCGS		DSGQGAPPHG		SPALLLLTTL		LGTASPLVF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Lin J.C., Ho W.-H., Gurney A.L., Rosenthal A. (2003). The netrin-G1 ligand NGL-1 promotes the outgrowth of thalamocortical axons. Nat. Neurosci. 6: 1270—1276. PMID 14595443 DOI:10.1038/nn1148

Див. також

• Хромосома 1